广东，倭寇的声势依然很大。跟福建一样，主要的原因是沿海人民生活困苦。“海滨之民，疲弊甚矣！官司之所困，征役之所穷，富豪之所侵，债负之所折，怨入骨髓嘉靖四十年的广东巡抚潘季驯说：“岭表去京师绝远，比年牧民者视为利薮，屠剥万状，而小民仰九重如在云霄之上，愁苦之声无路上达，故相聚为盗
哪里有压迫，哪里就有反抗。压迫越厉害，反抗就越激烈。因此广东的战争规模在东南四司中最大、持续时间最久、战况也最惨烈。
广东倭寇的首领，和福建一样，多出自穷人。老牌的饶平黄冈人许栋是从从小开始就做了海盗，极具海盗“经验”；他的养子许朝光也同样从小就做了海盗；曾一本是盗墓人出身；澄海的林道乾曾是吏员，算是他们中比较有文化的人。
不过广东的倭寇当中最厉害的当属吴平。吴平，年少时当过富贵人家的佣人奴才，因为不堪忍受雇主婆的虐待，逃出来后转行做了盗贼。后来加入倭寇队伍为别哨。等到倭寇被消灭的时候，吴平统帅那些流亡的倭寇，劫掠广东地区。吴平吸纳被明军击败的流散倭寇，势力越来越大，拥有军事力量约两万人，加之其人短小精悍，甚有智谋，所以当时许朝光、林道乾、曾一本等海寇集团都很推崇吴平，“平亦偃然居群贼上”，成为当时闽广海寇集团的总首领。
不过这广东的抗倭局势，一开始和我们的戚继光同志那是没有半毛钱的关系，除了最后打击广东的寇首吴平的那一战，其它的抗击倭寇的战争都是俞大猷发起的。
要说这戚大将军入广东抗倭的背景啊，就不得不说当时广东的抗倭局势。
俞大猷改任广东总兵时，潮州倭寇号称二万，与大海盗吴平互为犄角。俞大猷认为急攻没有胜利的把握，于是招降吴平。吴平假意投降，向俞大猷下跪哭泣，装作很诚恳的样子。这大猷将军一高兴了，就将他安置在梅岭。
尽管后来吴平又造反了，但他的行为给起义军带来很大损失。当时蓝松三、伍端、温七、叶丹楼等在惠州、潮州间活动。福建的程绍录在延平，梁道辉在汀州与他们彼此接应。
俞大猷已经有了常胜的威名，而且吴平又已经投降，他便自信的单骑入绍禄营劝降，并命令道辉一同返回故乡，这两人出于恐惧接受了命令，但很快被埋伏好了的官军杀死。
广东方面，伍端、温七的义军击败了惠州参将谢敕。但他们听说“俞家军”来了，十分害怕，伍端竟自己逃跑了。不久，俞军来到，击败温七并抓住了他。伍端估计无法逃月兑，自缚乞降，提出愿意杀倭自效。
这俞大猷一想啊，有白送的苦力啊，不用白不用，于是乎，这大猷同志便驱使伍端同志的战士为前驱，官军在后督战，围攻其他倭寇于邹塘，一日一夜就攻破了三个营盘，杀死四百多人。后来他们又在惠州海丰打胜了一仗。
倭寇都逃往崎沙、甲子等峡湾，抢夺渔船出海，不幸遇到大风，小船大量沉没，只剩下二千余人，回来在海丰金锡都驻守。大猷包围他们两个月，造成粮食枯竭，倭寇只能撤退。途中遭到早已埋伏好的副将汤克宽截击，大败。克宽亲手阵斩他们的三名头目。很快参将王诏等的军队也相继赶到，倭寇大溃败，死亡一千二百多人，逃到潮州去了。就这样，他们的恐惧帮助俞大猷获得了战斗中得不到的东西。
后来，大埔的兰松山、余大春等聚众数千人，在福建漳州、延平、兴化、泉州一带活动，被官军击败。转进到永春，与山民苏阿普、范继祖等部联合，转战漳平、龙岩等地。南赣巡抚吴百鹏停止军事行动，假装要招安他们。乘义军懈怠，率兵急袭，使他们遭到了歼灭性的失败，余大春、兰松山、范继祖等都被俘虏，只有苏阿普逃月兑。
战争进行到这个时候，可以说倭寇已经陷入绝境，他们在战略上已不可能打开局面，而战术上的优势又丧失殆尽，几乎每战必败。除了有经验的海盗还能借大海活动以外，陆上战争的结束，已成定局。因为胡宗宪已经被撤职，因此俞大猷、戚继光都想在自己的手里，以光荣的胜利结束战争。
于是乎，在最后的这一时刻，两人争执不下，最后还是嘉靖皇帝大手一挥，这两个大刽子手进入广东，战争进入了最后阶段。
抗倭的最后时刻，一五六四年，因为没有粮食的供给，徐永泰率领柘林水兵四百人发动兵变。他们与义军联合，进逼广州。前来镇压的冠军被击败。提督两广侍郎吴桂芳以招抚为幌子，暗中调集舰队，带着副将汤克宽、参将门崇文在惠阳击败了他们，但变兵余部仍凭借大船继续抵抗。
这时澳门的葡萄牙人一见到有便宜可以占，连忙提出可以参与明军的镇压，俞大猷同意了——尽管他一开始就没打算代葡萄牙人转达进行朝贡贸易的请求。于是官军与在迪奥戈？佩雷拉率领下的三百名葡萄牙人及其两艘船舰，在三门海消灭了变兵。事后明朝赠送了一些礼物，葡萄牙人在澳门的居留权也得到了默认。
十二月，南韶山民马五起义，在乳源、江湾等地击败官军，俘虏并杀死了守备贺铎、指挥蔡允元等明官吏，这是战争后期罕见的胜利。就这样结束了一五六四年的战局。
第二年年初，也就是抗击倭寇的倒数第二年，一五六五年，倭寇在浙江温州、台州一带活动，被官军击败。从海上去往福建。四月，攻击福宁。戚继光率参将李超等率水陆军反击。杀死二百余人，追击到永宁，又杀死三百多。
同月，吴平重新造反。他修建和夺取了数百艘战船，聚众万余，筑成三座要塞，在广东潮州、惠州；福建诏安、漳浦一带活动。引起了朝廷的注意，戚继光带兵前往镇压。因为听说吴平用兵厉害，没有迅速进攻，而是修建工事等待战机，夏季，他找到机会，发起突击。击溃了吴平的陆军。吴平作了有计划的撤退，将辎重转移到船上，率余部撤往海保、安澳两处峡湾。把总朱讥率舰队前往进攻。被击败身亡。本年的战争就这样过去了。
一五六六年一月，俞大猷率水师、戚继光率陆军联合大举进攻。
“俞兄，我们又能并肩作战了！”一见到俞大猷，戚继光舒怀的说道。
“好啊好啊！有戚将军在，这群倭寇是逃月兑不了灭亡的命运了，我还从来没有看见过有倭寇能够从你戚大将军的手中逃月兑的俞大猷也很乐意跟戚继光合作。
“现在吴平已经退守南澳港口了，我命我手下的水师满载石块，将船沉在了南澳港，现在倭寇的大型船只是出不去了，他们只能坐以待毙，就是我们碗里的肉，我们想什么时候吃就什么时候吃
“戚大将军果然不同凡响啊！老俞我佩服，佩服啊！”俞大猷冲戚继光竖起了大拇指。
一番商量之后，两人决定由戚继光率领戚家军从陆路进攻，而俞大猷则是率领水师水上拦截。
选了一个良辰吉日，戚继光命令胡守仁、陈大成等人率领精兵三千率先从龙眼沙一带登上了南澳岛。这南澳岛还是比较大的，吴平根本就不能全岛防守，等到他知道戚家军已经登上了南澳岛，并派兵前来挑战时，已经迟了，戚家军早已经在龙眼沙附近修筑了防御工事，并打败了前来挑衅的倭寇。
“今天，我们将对南澳岛上的倭寇进行攻击，只要我们打败了南澳岛中心的倭寇，东南沿海就差不多平定了，十几年的抗倭战争也就结束了。为了这最后的战争，将士们，勇敢的战斗吧！”
接下来，戚继光开始分配战斗任务，陆战部队分为三支，左中右各一支，分别由胡守仁、戚继光、陈大成三人率领。三路大军一齐围攻吴平营地，炮火和炸弹都用上了。
吴平率领部下退到木城堡垒，指挥部下竭力拼杀，但是怎么也禁不住戚家军的三路猛攻。熟悉地形的吴平，带领几百人乘四五十艘小船从海上逃窜。
听闻消息后，俞大猷立马带人上去劫杀，一阵拼杀之后，还是让少数的倭寇逃月兑了。
正在这时，一艘大型的福船突然出现在了大海之上，船上空荡荡的，只站立着两个人。一个断臂的男子和一个红衣的女子。
只听见这断臂的男子对着前方倭寇的船只一声怒吼，刹那间，如同海啸一般，大海之中刮起了一阵龙卷风，瞬间就将前方倭寇的十几艘小船全部掀翻，船上的倭寇全部掉落到海中。
“我的妈啊！这两人是谁啊，怎么这么厉害！”俞大猷骇然地自言自语。
“狼军！没错，大人，他们就是狼军，他们两人是狼军当中的十位将军中的两位，十大天干之中排名第七和第八，天地书生冷水易，明教教主烈火蓉
广东巨寇吴平的好运到此结束，之后再没有人得到他确切的消息。有人传说在南直隶与浙江一带见过他，已经成了大商人，后来又回到广东，在旧时朋友处偷偷掘取了先前为盗时埋下的珠宝；有人说他在海岛中困饿而死。比较起来，后一种说法比较可靠些。
至此，惨烈的倭寇战争实际上已经结束了。尽管之后广东仍有大战，一直持续到万历初年，但无非是海盗入侵，间杂着越来越少的贫民起义，他们的结局，无一例外的是失败。这样的战争与其说是为了胜利，不如说是倭寇余部和活不下去的人民愤怒的进行自杀式攻击。他们没有希望，仅仅是为了博取有尊严的死亡而战斗到最后一刻。东南战争已经不再是明朝关注的重点了。
而十大天干，也开始了他们崭新的生活。
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