其实不光是王守仁看到了旧港的宗教矛盾，周重也早就注意到了旧港的那些穆斯林，毕竟大明西北的回民与汉民之间的争斗也是不断，甚至是经过几百年的融合，但后世之时依然不时听到回民与汉民冲突的事，更何况旧港刚开始就是一个穆斯林城市，现在忽然出现那么多的汉民，若是不出现矛盾那才叫有鬼呢。
也正是因为如此，所以周重在接到王守仁对旧港宗教矛盾的禀报后，立刻召集焦芳和张彩商议事情，其张彩更是甘肃人，他老家那边就有不少回民，所以对于处理这种宗教矛盾的问题，他很快就想到了应对之法。
张彩的建议首先就是划分居住区域，也就是把旧港一分为二，其老城区依然让那些穆斯林居住，而在老城区之外再建造一座新城，以容纳新移民的到来。
当然仅仅是分开居住还是不够的，张彩的第二条建议就是以官府为主要力量，教导新移民要懂得尊重别人的风俗习惯，特别是穆斯林的一些禁忌，也要大力宣传，使得新移民不至于在不知不觉触犯了对方的禁忌。与此同时，官府也要教导那些穆斯林要学会宽容，他们可以保持自己的风俗习惯，但却不能强迫别人也遵守他们的风俗，哪怕是看到别人在自己面前触犯了穆斯林的禁忌，他们也不能上前指责，毕竟除了官府之外，没有任何人可以强迫他人按照自己的行为准则做事是。
张彩处理宗教矛盾的办法算不上高明，但却规矩，而且这也是现阶段周重能做到的最好办法，所以他很快给旧港知府李义去了道公，要求他结合旧港的实际情况。按照张彩提出的几点办法酌情处置，同时周重也给王守仁也下了道公，让他们按察使司留下人监督旧港的宗教矛盾。
帮着李义处理了一下旧港的宗教矛盾后，王守仁对四海总督府治下的州府考察也终于完成了，于是他在旧港直接乘船回到双屿港。并将自己这一路上的见闻，以及对四海总督府未来的发展方向写成书交给周重，然后开始真正的着手整治总督府的吏治。
王守仁一出手，就把矛头指向了私德有亏的张彩，说起来张彩年轻时，甚至还开口向属下讨要小妾。可以说人品很有问题，现在年纪大了，没有精力再去了，但却开始变得贪财起来，本来大明官员的俸禄很少，全都靠各种灰色收入支撑。甚至这已经成为官场上的潜规则，所有人都知道但却没有人敢说破。
周重对官场上这种灰色收入十分反感，一来官员收下这些灰色收入，容易滋生贪婪之心，二来这种灰色收入并不透明，身为总督的他也很难监控，所以周重在总督府刚刚成立时。就严禁总督府的下级官员私自收受财物，也就是将所有灰色收入一下掐断，不过周重也知道官员只靠俸禄是养不活全家的，所以他将那些灰色收入掐断后，干脆由暗转明，将各种名目的灰色收入变成总督府的补贴发下去，这样一来官员的收入也能更加透明，也便于周重对下级官员的监管。
周重对总督府的财政做了改革，大部分官员也都对这种改革表示欢迎，毕竟他们不必像以前那样担心吊胆的收钱了。而且收入也并没有减少，自己也不必承担风险，所以大部分官员都是严格遵守周重立下的规矩，没敢再收受任何名目的灰色收入。
但是张彩这个人却是好了伤疤忘了疼，他与焦芳在总督府站稳脚根。并且取得周重的信任后，贪婪的心思再一次升起，开始收受一些别人的贿赂，不过他虽然收钱，但是却也不会做的太过分，比如周重吩咐的一些事情，哪怕他是别人出再多的钱，他也不敢打丝毫折扣，因为他十分清楚，自己这位年轻的上司可不是好糊弄的，万一因为一些钱财而导致周重对自己不信任的话，那他日后的前途可全都毁了。
张彩收受贿赂虽然十分小心，但可惜他遇到了王守仁，历史上的王守仁在用兵方面就是奸诈出名，现在他把自己用兵时智慧用在官场上，同样也是无往而不利，比如王守仁就让人假扮商人向张彩行贿，结果张彩一时不察就收下了，这下让王守仁抓了个人赃并获，这应该就是后世钓鱼执法的前身了。
对于张彩收受贿赂的事，周重其实也有所察觉，毕竟双屿港本来就是他的地盘，任何风吹草动都逃不过他的眼线，只不过张彩虽然受贿，但做事却极有分寸，有些不该拿的钱，他是打死都不会拿，再加上周重又十分看重张彩的才能，所以对张彩受贿的事视而不见。
不过周重之前可以装做不知道，但是现在张彩受贿的事却被王守仁抓了个现形，这下周重就不能再装傻了，幸好张彩受贿的数额不是很大，王守仁也没想真的要把张彩制于死地，他只是想通过这件事向北方官员立威罢了，所以并没有向朝廷禀报，而是私下里交给周重处置，最后周重只好将张彩收受的贿赂充公，然后又处置了张彩家直接收下贿赂的家人，虽然这样的处罚并不重，但王守仁也并没有追究。
借着处置张彩这件事，王守仁迅速在总督府树立起自己的威望，老谋深算的焦芳在打听了一下王守仁的过往，以及他在台湾三地的考察经过后，十分明智的选择了退让，之前受到压制的南方人也终于可以出头了，不过王守仁也不敢过分逼迫，毕竟焦芳和张彩哪个都不是易与之辈，而在南方官员，也只有自己可以勉强与两人相抗衡，与他同级的杨统根本就不是两人的对手，所以王守仁也见好就收，总督府的南北官员势力也慢慢的恢复了平衡。
另外值得一提的是，以达伽马为首的葡萄牙使团在北京居住了近半年后，终于带着正德签署的通商书离开了北京，这份书的内容其实就是之前周重与达伽马已经达成的协议，现在只不过由正德再次签字确认，同时也更加保证了这份条约的合法性。
达伽马在离开北京之后，还特意来到双屿港向周重告别，而且这次见到周重后，态度却变得更加的恭敬，多次强调自己在回去之后，就会立刻支付剩下的百万两赔偿，同时也希望周重遵守双方之前签署的合约，大力推动发展大明与葡萄牙之间的贸易。
对于达伽马表现出来的恭敬，周重并不怎么高兴，因为他知道达伽马之所以变得之前恭敬，是因为他在大明呆的这半年里，肯定已经看清了大明的虚实，知道整个大明只是一个虚弱的巨人，根本不像他们之前想像的那么强大，而且大明上下都对海洋抱着一种可有可无的态度，哪怕是现在大明已经从海洋赚到无数的财富，但是大明对海洋依然不怎么重视，这个发现对于达伽马来说，简直就是天赐之喜。
不过大明上下虽然对海洋不怎么重视，但是其却有一个例外，这个例外就是周重，达伽马之前在双屿港呆过一段时间，知道周重的四海总督府在海上拥有极强的力量，甚至可以毫不夸张的说，仅仅一个四海总督府，就已经拥有打败他们葡萄牙王国的力量，而且更加糟糕的是，那个年轻的总督似乎还十分受到大明皇帝的信任，大明朝廷也对总督府的发展提供了大量的支持，也正是因为如此，所以总督府在海上的实力几乎是一日千里。
可以说达伽马的这一次北京之行，不但让他搞清楚了大明的虚实，同样也搞清楚了周重这个年轻总督对大明的意义，甚至可以毫不夸张的说，周重就是大明的海上皇帝，所有与大明有关的海上活动，都离不开周重的支持，他们葡萄牙人日后想要与大明交易，同样也需要与周重打理好关系，甚至若有可能的话，达伽马还希望可以找到周重的弱点，只要能够击败周重，那么整个大明的沿海都将对他们葡萄牙王国开放。
也正是因为上面这些原因，所以达伽马再次见到周重时，态度变得十分的恭敬，甚至可以说是谦卑，毕竟现在他们葡萄牙人在亚洲这边的实力大损，短时间内根本无力与大明争锋，更何况现在周重的四海总督府实力发展飞快，天知道对方哪一天会杀进印度洋，所以现在对周重保持必要的恭敬，日后只有好处没有坏处。
对于达伽马的恭敬，周重却是十分的清醒，特别是他知道眼前这个葡萄牙人已经看清了大明的虚实，日后葡萄牙人若是再次积累起能够打败自己的实力，那他们绝对会毫不犹豫的动手，只要自己一败，整个大明的沿海就完了，所以他现在只能拼命的发展总督府的海上力量，甚至主动与葡萄牙展开竞争，最好能够将葡萄牙人的势力从印度洋那里赶出去。