他尝完一山花草，又到另一山去尝，还是用木杆搭架的办法，攀登上去。一直尝了七七四十九天，踏遍了这里的山山岭岭。他尝出了三百六十五种草药，为天下百姓治病。哪怕是有毒的草药他也会亲自尝一尝，然后观察自己的水晶肚，根据来亲自治疗，他把治疗的方法写了下来。
神农尝完百草，为黎民百姓找到了医病的草药，来到回生寨，准备下山回去。他放眼一望，遍山搭的木架不见了。原来，那些搭架的木杆，落地生根，淋雨吐芽，年深月久，竟然长成了一片茫茫林海。神农正在为难，突然天空飞来一群白鹤，把他和护身的几位臣民，接了下去。
往回走时一日被一群毒蛇围住。毒蛇一起向烈山氏氏扑去，有的缠腰，有的缠腿，有的缠脖子，想致烈山氏氏于死地。烈山氏寡不敌众，终被咬伤倒地，血流不止，浑身发肿。这时嫦娥与后羿来到了神农的面前，施展法力赶走了毒物，拿出一枚丹药救了神农，神农感激涕零，高声向师傅道谢，哪知，一张口，仙丹落地，立刻生根发芽长出一棵青草，草顶上长出一颗红珠。神农氏仔细一看，与仙丹完全一样，放入口中一尝，身上的余痛全消，便高兴地自言自语：“有治毒蛇咬伤的药方了！”于是，给这味草药取名“头顶一颗珠”。后来，药物学家给它命名为“延龄草”。
神农回到陈都后，开始专心书写《神农本草经》。可他的两个女儿，却相继出事了。有两个女儿，大女儿叫瑶姬，小女儿叫女娃。她们一直和父亲一起幸福地生活着。有一天，女娃驾着一只小船去东海游玩。突然大海变的波涛汹涌，白浪把她的小船打翻。女娃因为太小没有经验，来不急施法术自救，就被海浪无情的吞噬了。
她的姐姐瑶姬在一旁看到，急忙赶往东海边抢救。但，大海茫茫，哪有妹妹女娃的踪影？女娃虽然溺水，她的哀怨、不平的灵魂化作一只花脑袋，白嘴壳，红色爪子的鸟，栖息在西方的发鸠山森林里，因为经常发着“精卫、精卫”的鸣叫，人们就管这种鸟叫精卫或精卫鸟。栖息在西方发鸠山上的森林里，然后开始它一天的工作，衔取一颗小石块，或是一段寸余长的树枝，从发鸠山飞往东海，把石块和树枝投入当年溺水的海面上，发誓要把东海填平。就这样日复一日，年复一年，精卫鸟一直在填平着东海。这样年复一年，日复一日的坚持着，一定要把东海填平。大海奔腾咆哮着，一条金龙飞来嘲笑它说：“小鸟呀，你就是干上一百万年，也休想把大海填平！”精卫在高空中答复金龙：“哪怕是干上一千万年，一万万年，我也要把大海给填平！”
原来这条金龙乃是东海龙王三太子，两人曾经有过这么一段过节。一次三太子跑到陆地上来游玩。走累了，就想骑马，看到一旁的玩耍的几个小孩。三太子将让他们给自己当马骑。而刚好路过的女娃，看到一个大孩子把小孩子当马骑。小孩都累爬下了，大孩子还不肯罢休，就愤怒了。喜欢打抱不平的精卫走过去，指着大孩子的脑门怒斥道“你这个人太不知羞耻，欺负小孩子算什么本事，有力气，去打虎打熊，人们会说你是英雄。”
大孩子见精卫是个小姑娘，生得单薄文弱，根本不把她放在眼里。他从小孩背上跳下来，走到精卫面前说“我是东海龙王的儿子，你是什么人？竟敢来管我！”精卫说“东龙王的儿子有什么了不起，我还是炎帝的女儿呢，以后你少到陆地上撒野，小心我把你挂到树上晒干。”
龙王三太子说“我先让你知道知道我的厉害，往后少管小爷的闲事。”说着动手就打。精卫从小跟着父亲上山打猎，手脚十分灵活，力气也不小，见对方蛮横无礼，并不示弱，闪身躲开对方的拳头，飞起一腿，将龙王的儿子踢个嘴啃泥。龙王的儿子站起来，不肯服输，挥拳又打，被精卫当胸一拳，打个昂面朝天。龙王三太子见打不过精卫，只好灰溜溜地返回大海。
而就在不久后的一天，精卫到东海中坐着小船游玩，正玩得十分开心，刚巧让东海龙王的三太子发现了。他游过来，对精卫说“哪天在陆地上让你捡了便宜，今天你跑到我家门前，赶快认个错，不然我兴风作浪淹死你。”精卫倔强地说“我没错，认什么错。”龙王的儿子见精卫倔强，根本没有服输的意思，立即搅动海水，掀起狂风恶浪，精卫来不及挣扎，就被淹死。
神农听说了女娃的事情后，泪流满面，却是毫无办法。而瑶姬亲眼目睹自己的妹妹被海浪淹死，也是自责不已。回来后，就一病不起，卧倒在床。来势汹汹的病魔很快就将她击倒在地。从此，她就只能躺在病榻上了，显得非常憔悴。渐渐地，瑶姬已经病得站不起来了。
溪流边，没有了瑶姬梳妆的身影，溪流仿佛在呜咽着；微风里，没有了瑶姬灵动的身姿，微风仿佛也在呼唤着。渐渐地，瑶姬已经病得站不起来了。神农心急如焚，但却束手无策：自己虽是医药之神，但药能医病，却不能让人起死回生。
不久，瑶姬就死了，被安葬在巫山上。瑶姬是神农之女，有大气运庇佑。就像精卫落水身死而化精卫鸟一样，她的香魂飘到姑瑶山化作芬芳的瑶草。瑶草花敕黄，叶子双生，果实似菟丝子。女子若服食了瑶草果，便会变得明艳美丽，惹人喜欢。这瑶草在姑瑶山吸收日月精华，千年后慢慢的修炼成了人形，就是人们一直以来所说的巫山神女——瑶姬。
神农的两个女儿都要死了，虽然悲伤难过。但为了人族早日不再受到病痛的折磨，还是毅然决然的继续书写药典。三年后终于完成了这部医学著作《神农本草经》，天际间，功德金光飞落而下，落在了神农的身上。瞬间神农的修为就超越了准圣，达到了圣皇之位。
而在陈都感应到天降功德，便知自己的徒弟功德圆满的嫦娥，也欣慰的笑了笑。就在她和后羿要回归蓬莱岛的时候，有接到简云的传音。来到了人族的一个名叫白水的地方，来收她的第二个徒弟，此人名唤仓颉。
在此那个时候，人们结绳记事，即大事打一大结，小事打一小结，相连的事打一连环结。后又发展到用刀子在木竹上刻以符号作为记事。随着历史的发展，文明渐进，事情繁杂，名物繁多，用结和刻木的方法，远不能适应需要，这就有创造文字的迫切要求。
嫦娥收下仓颉后，便让他去神农手下当官。那时，当官的可并不会显得威风，和平常人一样，只是分工不同。神农分派他专门管理圈里牲口的数目、屯里食物的多少。仓颉这人挺聪明，做事又尽力尽心，很快熟悉了所管的牲口和食物，心里都有了谱，难得出差错。可慢慢的，牲口、食物的储藏在逐渐增加、变化，光凭脑袋记不住了。当时又没有文字，更没有纸和笔。怎么办呢？仓颉犯难了。
仓颉整日整夜地想办法，先是在绳子上打结，用各种不同颜色的绳子，表示各种不同的牲口、食物，用绳子打的结代表每个数目。但时间一长久，就不奏效了。这增加的数目在绳子上打个结很便当，而减少数目时，在绳子上解个结就麻烦了。仓颉又想到了在绳子上打圈圈，在圈子里挂上各式各样的贝壳，来代替他所管的东西。增加了就添一个贝壳，减少了就去掉一个贝壳。这法子挺管用，一连用了好几年。
神农见仓颉这样能干，有心栽培他成为下任人皇。于是叫他管的事情也是愈来愈多，年年祭祀的次数，回回狩猎的分配，部落人丁的增减，也统统叫仓颉管。仓颉又犯愁了，凭着添绳子、挂贝壳已不抵事了。怎么才能不出差错呢？
可是，他苦思冥想，想了很长时间也没造出字来。说来凑巧，有一天，仓颉正在思索之时，只见天上飞来一只凤凰，嘴里叼着的一件东西掉了下来，正好掉在仓颉面前，仓颉拾起来，看到上面有一个蹄印，可仓颉辨认不出是什么野兽的蹄印，就问正巧走来的一个猎人。猎人看了看说：“这是貔貅的蹄印，与别的兽类的蹄印不一样，别的野兽的蹄印，我一看也知道。”仓颉听了猎人的话很受启发。他想，万事万物都有自己的特征，如能抓住事物的特征，画出图象，大家都能认识，这不就是字吗?从此，仓颉便注意仔细观察各种事物的特征，譬如日、月、星、云、山、河、湖、海，以及各种飞禽走兽、应用器物，并按其特征，画出图形，造出许多象形字来。想通之后，仓颉高兴的手舞足蹈。
而不远处的一座山峰上，出现一只凤凰和一名猎人。凤凰化作嫦娥，猎人化作后羿的模样。嫦娥看着手舞足蹈的仓颉，笑着感叹道“真是笨死了，我怎么就收了这么个徒弟啊！一点都不让我省心，真是太不孝了。”后羿把嫦娥揽在怀里，刮了刮嫦娥秀美的鼻子。赞同的说道“的确，跟神农比，确实是比差远了。”