永歷要做瓷器生意，順道還踫到了一個夢寐以求的大寶貝——方以智。這個方以智在明末可是有相當大的名氣，但是命運也夠多劫。方以智，安徽桐城人，出生于書香世家，性情耿直不阿，崇禎十三年中一甲進士，選為翰林院庶吉士，李自成攻破北京後，不願投降，被關進大牢，滿清入關後，得以逃月兌，後歷仕于弘光朝和永歷朝，但都因柄直的個性丟官出走。
特別是在永歷初年，因為當年的永歷孱弱膽小，又被太監奸臣蒙蔽，所以憤而出走，歷經輾轉，最後在青原山青帝寺出家為僧。
現在的永歷怎麼知道過去的故事，他的腦袋里就知道這個方以智乃是歷史上著名的科學家，著有多部科學典籍，精通數學、物理、天文、醫學等，可謂是博物學家。這麼個寶貝被永歷踫到，當然不能叫他跑掉，當下就提出一起回贛州。可是老和尚把腦袋晃的像是撥浪鼓，任憑陳起月磨破了嘴皮子，就是不同意永歷的請求。
永歷見這老和尚心里好像對自己存有芥蒂，也不多解釋，使個眼色叫人過來，扛起方以智就走，任憑他高聲叫喊，就是不讓放下，直接塞進馬車里，然後永歷也一坐了進去，拽過方以智的手來，「含情脈脈」的看著他，看得方以智這個老和尚很是不好意思。
「陛下，為何如此看老衲，當年老衲棄陛下而去，真是罪該萬死！」方以智低聲說道。
「不，不，方先生，你可是朕仰慕之人，我現在已經不太記得過去的事情了，因為……」于是永歷把在雲南發生過的事情簡單的復述了一遍。尤其是死而復活的經歷，使得方以智大感匪夷所思，盡管不是很相信復活的可能，但是永歷現在活生生的舊坐在自己面前，而且好像性情也有所變化，不似過去一般優柔寡斷，而是堅毅果斷，這種變化是值得肯定的。思索再三，方以智最終還是決定留下，畢竟對大明還是心懷情感的。
三天以後，永歷等人回到井岡山下的長坪鎮，將瓷器先存到庫房，然後邀請方以智一起去井岡山里的大本營。
此時，井岡山大井地的工程已經初具規模，山中堪用大樹和巨石到處就是，只需派人去開采出來就行，所以建設的也比較快。李定國不愧是統軍帥才，根據地形地勢，因地制宜設置了不少防御工事，諸如地洞暗堡之類的隨處可見，將井岡山打造成了鐵桶般的要塞。永歷可不是要在這里長住的，所以感覺有點浪費，不過方以智看到如此情景，顯得相當開心，看著永歷的眼神也變得相當崇拜。
李定國接到消息後，早早就帶人出來迎接。方以智並不認識李定國，因為他出走的時候，李定國還沒有擁戴永歷，但是兩人早就听聞過彼此的大名，所以相見之時，兩位老臣也是把手寒暄，惺惺相惜很是熱切。
永歷雙手握著李定國和方以智的手，來到已經建好的議事廳，分尊卑落座後，當即加封方以智為內閣大學士，工部尚書餃。以明制，沒有軍功不得封爵，否則的話，永歷就要直接封方以智為侯爵了。
方以智見到永歷對自己如此封賞加恩，雖然這些官位都是有名無實，但起碼能看得出永歷是十分看重自己的。連忙跪下叩頭謝恩，也不再想著離去了，心中暗下決心誓死相從這位大明皇帝。
方以智被封為內閣大學士，這可是永歷歸來以後第一次建立內閣，說明永歷是何等的信任這個「棄臣」。可就是這點被陳起月所不理解，尤其是永歷好像忘記自己一般，自己這個堂堂的兵部尚書，竟然沒有入閣，心中大感不滿。
當天晚上，永歷，李定國與方以智一起用過晚宴後，命退了侍衛，三人開始秉燭夜談。
方以智對永歷心懷感激，盡管已經五十余歲的，人逢得意精神爽，說話也是中氣十足，「陛下，臣萬萬沒有想到陛下轉戰千里，由雲南入江西，潛入清廷月復地，在這井岡山中開創如此基業，此乃前無古人之例，陛下勇氣睿智無人可及啊。」
馬屁的拍的山響，還是「歷史名人」方以智拍的，永歷听了是真舒服，老臉一紅，道「方愛卿，言重了，朕這也是置之死地，而後生」接著嘆了口氣，接續道「我華夏五千年屢次被落後民族侵擾，想我大明百年基業竟毀于滿清韃子之手，此乃大不幸也！」
李定國在旁連連點頭，也面帶愧色道「昔日，我跟從大西，陷大明于危難，現在想來也是內心難安。」
「哎……官逼民反，民不聊生，誰都有錯，就是先帝也有錯處，晉王無罪，只有有功！如果朕能光復河山，一定要善待百姓。」永歷的腦袋里邊裝的可不是什麼君貴民輕高高在上的思想，他可是受過無產階級教育的，內心十分看重老百姓，所以才有了以上那番話。
李定國出身農民，永歷這番話最是認同；方以智也許是這個世上最開明的人了，思想也比較先進，尤其是對永歷敢于批評自己的老祖宗，更是深表贊同，感到現在的永歷爺真的和以前的永歷不一樣了。
永歷見到兩人對自己的話都表示贊同，微微一笑，「方愛卿，朕以井岡為中心，輻射四方，等待時機，群起呼應這條計策，可行否？」
方以智是何等聰明，當然知道永歷的心意，這井岡山地處贛南，距南京也不過一千里，如果時機一到，大軍急進，不出十天就可到達南京城下，如猛虎掏心一般，于是重重的點下頭，道「陛下，此乃奇策，但也要考慮周到，首先是滿清在江南統治日趨穩固，士人漸漸歸心；還有天下現在只有夔東義軍反清，其他義軍不是勢小就是目的不明，將來以孤軍犯險，成功幾何？」
「嗯，千里犯險，棋錯一招，滿盤皆輸。我軍現在勢單力孤，對滿清還顯力量不足，另外四周強敵環侍，而我軍勢力只限井岡山和梅山，又無盟友。最主要的是清廷統治日趨穩固，給我軍發展的時間越來越不少，難處不少啊」永歷將自己的憂心之處一一道出。
「可以聯絡夔東的義軍，首領李來享，郝搖旗等人五年前曾經派人去雲南，表示歸順大明，雖然他們是逆賊後人，確是堅定反清的。」李定國說道。
「賊心難策，畢竟是闖賊的余孽，怎可相信？只能善加利用爾。」方以智說道，說完才想起李定國也是大西軍出身，立刻感到有些尷尬，好在李定國不已為意。
永歷拂須，惡狠狠地道「只要是反清，我們就歡迎，互相利用嘛，不要以為滿清就是鐵板一塊，他們也有頭疼的地方，比如內部權貴爭權，西南三藩，北方的蒙古準格爾部也蠢蠢欲動，現在中原是太平了，咱們就要他不太平，將他弄亂，越亂越好。」
方以智看著永歷一邊說著，一邊目露凶光，心道「這還是我當年的皇帝嗎？可要知道，天下大亂，亂軍四起，最苦的還是百姓。」連忙道「陛下所言甚是，可還是要少造殺孽，畢竟苦的還是百姓啊！」
「天下亂，百姓苦；天下興，百姓苦。百姓久經戰亂，人心思定，所以才會屈服于滿清殘暴的統治，以求太平的能過太平日子。可是清廷這些年來橫征暴斂，以供養滿人，什麼鐵桿莊稼，就是吸盡民脂民膏，百姓愚昧，我們要發動他們，啟蒙他們，要他們起來反抗！，要他們知道只有朕才能給他們吃給他們穿，要他們知道只有擁護朕，天下才能真正太平！」永歷握緊拳頭，站起身來，大聲說道。
此時，一個計劃正在永歷的腦袋中出現——「我要挖清廷的牆角，我要把我的人派到清廷的內部去，從內部搞垮他們！」想道這，永歷還給這個計劃起了個名字——「無間道」。
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