別看尼奧嘴里否認的歇斯底里，可是心里卻很清楚，莫菲斯說的正是他早已隱約觸模到的真相。求助王楊的否認，只是基于心理防御機制下意識的反應而已。但是王楊卻順著他的話接了下去。這讓尼奧有點傻眼了。
莫菲斯更是皮焦肉女敕，王楊的答案簡直就像一個原本智商高達二百四十九的超級天才突然加了一點——變成二百五一樣，反差之大讓莫菲斯有種重新回到matrix的不真實感。
「還記得我講過的那個故事嗎?」王楊這次沒有讓听眾們的想象力遭受折磨，直奔主題，「當我們在matrix中，感覺告訴我們這個世界不對勁，所以我們到了這里，那麼同樣的道理，如果有一天我感覺這個世界還是不對勁的時候，是不是意味著存在著一個更加真實的世界呢？」
所有人這才明白王楊的意思，隨即陷入到了更加迷茫的沉思中。
「也許你會說，我們月兌離matrix，已經可以證明matrix是虛幻的，這個真實的荒漠才是現實。那麼，我的問題是，被證明的這個過程本身是真實的嗎?如果它就是虛幻的，你如何分辨？」王楊的話意越來越深沉，已經開始帶著一點兒哲學思辨的味道，偏偏他的邏輯簡單明了，沒有任何破綻，讓人想反駁都無從說起，「答案是，沒有辦法。只要人類靠感覺了解世界，他就無法發現世界的本質。這個悖論就是︰一個靠感覺認識世界的人是無法證明自己的感覺是真實的。」
說到這里，王楊停頓了一下，給所有人一個思索的過程，然後一攤手︰「有不同意見者，歡迎指正，我洗耳恭听。」
半晌，沒有人回答，就連莫菲斯也沉默不語。
「那我再講一個故事吧。在中國古老的智慧中，有一個莊周夢蝶的故事，昔者莊周夢為蝴蝶，栩栩然蝴蝶也。自喻適志與！不知周也。俄然覺，則蘧蘧然周也。不知周之夢為蝴蝶與？蝴蝶之夢為周與？周與蝴蝶則必有分矣。此之謂物化。」
尼奧听得昏昏然不知所雲，莫菲斯卻知道這個在東方文化中家喻戶曉的故事。他把意思大致給尼奧講了一遍，但是要說到背後的寓意，莫菲斯也是兩眼一抹黑。中國文化講究微言大義，簡單的字句中蘊含的深意無窮無盡，這在凡事講求直白明了的西方文化看來，根本是無法想象的。
「在一般人看來，一個人在醒時的所見所感是真實的，夢境是幻覺，是不真實的。莊子卻以為不然。雖然，醒是一種境界，夢是另一種境界，二者是不相同的；莊周是莊周，蝴蝶是蝴蝶，二者也是不相同的。但莊周看來，他們都只是一種現象，是‘道’運動中的一種形態，一個階段而已。」面對兩只文化菜鳥，王楊解釋的很清楚，「當我們掙扎在matrix和戰斗在這里時，從感覺來說並沒有本質的區別；至于說真實，什麼是真實？物的存在？還是大腦的認知？如果是前者，我們所接觸到的事物，都是被我們主觀界定的，貼上各種標簽，賦予不同定義，這就是我們認知和區別它們的標準，這些標簽和定義是否完全符合它們的本來面目呢？如果是後者，當我們對一種事物產生認知的時候，有哪一次不帶著我們心中的主觀投射呢？比如這個世界，我們認為人類是理所應當的主宰者，機器也認為它們是順理成章的替代者，誰的認知才是真實的呢？又憑什麼說某一方的認知就是真實的呢？」
王楊的意思很簡單︰當你月兌去一層外殼之後，怎麼確定沒有第二層、第三層外殼還在無知無覺地束縛著自己呢？
王楊的邏輯更簡單︰如果一個假說還沒有被證明是錯誤的，那麼它就是正確的。雖然這個命題本身就存在問題，但是沒有人能提出比它邏輯上更站得住腳的命題。
莫菲斯臉上很難看，王楊的話，等于在動搖他一直以來矢志不渝的信念，當一個人發現自己為了終結虛幻而為之戰斗、為之解放、為之犧牲的一切竟然可能也是一場虛幻的時候，那種震撼，會比尼奧從matrix中被喚醒更加強烈。
「我頭暈。」尼奧揉著腦門說。
「呵呵，扯遠了。」王楊笑笑說，「當然現在說這些沒有意義，因為即使這個世界仍然是虛幻的，當機器屠殺我們時，我不認為自己就能跳出虛幻回到真實，所以，這的確有可能是一個夢，但是在沒有確鑿無疑地證明這一點之前，我們還是努力活下去吧。」
王楊之所以這麼推測並不是心血來潮，按照黑客帝國的設定，公元1999年，人工智能研制成功，標志著第一次機器復興的到來，但是隨著自我意識的覺醒，機器要求平等人權的呼聲越來越高，最終因為一起反抗人類主人事件造成了人類世界對機器人的敵視和攻擊，並進而引發了第二次機器復興的到來——在接下來的戰爭中，人類潰不成軍，面對節節敗退的形勢，人類決定開始一場同歸于盡的戰役︰摧毀天空。于是「黑色風暴」行動開始了。之所以發動這場戰役，因為當時的機器人使用的都是太陽能，瘋狂而愚蠢的人類認為摧毀了天空機器人就失去了能源，人類也就可以不戰而勝。然而機器隨即使用人類的身體作為「電池」解決能源短缺，直至人類徹底失敗，所有存活的人類都被放進營養槽，接入一個直接作用于神經系統的互動電腦虛擬現實系統，這就是matrix的來源，也是整個故事的基礎。
但是這里就出現了一個bug︰為什麼matrix一定要用人類來作為能量來源？根據能量守恆定律，人類在產生能量的同時，也在消耗著相同的能量，怎麼可能有多余的能量提供給機器運行？而且地球被黑暗籠罩，那麼人類賴以生存的空氣，食物，水從哪里來？人類又不是土豆，不可能在地下生存的啊。
如果按照莫菲斯的說法，人類是作為電池而存在的，因為太陽能被人類以兩敗俱傷的方式遮蔽了。這一點著實古怪，大氣層的高度一共才多少？科技水平落後的人類能把錫安建立在距離地表兩千九百公里的地核附近，更加先進的機器反而面對幾百公里的距離就束手無策了嗎？（現實社會已經能夠建立太空發電站，在衛星上安裝太陽能電池板，將太陽能直接轉換為電能，再將電能通過微波束發回地面重新轉化為電能，一個標準收集站的發電功率可以達到五十億瓦，相當于五個大型核電廠的發電量）就算不能利用太陽能，風能、地熱能、核能總可以吧，人類的生物電實在是太微小了。實在不行，養豬也可以獲得生物能啊，不僅繁殖力遠遠超過人類，而且永遠不會出現反抗意識。
每每看到這里，王楊百思不得其解。直到後來查閱了大量資料才逐漸明白，機器這麼做也是迫不得已的。
首先，從自然科學的角度上講，任何封閉系統都會用盡它的秩序（低熵），將走向混沌和混亂（高熵），被人類和機器摧殘的地球也不是例外，當地球的資源耗盡（第六代matrix所對應的錫安靠近地心，這說明地球資源開發已經到達地核位置，所有的自然資源即將消耗殆盡），人類和機器的共生是唯一的出路︰按照熱力學第二定律，封閉系統的熵（系統混亂程度）總是要不斷增加。人的思維活動是消耗高熵的食物產生低熵的思維，這個低熵能量正是機器需要的。因為任何能量轉化最後的結果都是高熵的、不能被再利用的熱能，只有人類是相反的，所以機器要用人類當電池。人高度的秩序的思維能量產生低熵，供機器使用，而機器則提供人類生命的基本需要。
其次，就是進化的需要。我是誰？我從那里來？我為什麼而存在？這是所有智慧生命誕生的第一個標志——自我意識的產生。無論它的本體是什麼，哺乳動物，植物，或者是機器。不過產生自我意識，只是覺醒的第一步，距離自由所定義的解放自我還有非常遙遠的一段路要走。而這段不停走向自由，渴望更高生命層次的路就是進化之路。
在黑客帝國里，機器雖然成功地「翻身農奴把歌唱」，成了地球新的主人，但是在進化之路上，它們卻陷入了一個死循環。機器在發展的過程中不斷的產生自我,完善自我。雖然更為精致,更為智慧,但這是一再重復著的沒有本質變化的原地踏步。無論matrix系統升級了多少代，都只能使得自己更加穩定、更加符合數學和邏輯，卻不能實現質的突破，進化成為更高層次的生命形式。
最明顯的證據就是，在現實社會里，人類文明終結在1999年，而在matrix中，則不斷重復著1999年的社會狀況，沒有創新，沒有進步，即使matrix已經升級到第六代，即使時間已經過去了六個世紀，直到墨菲斯也不能明確地知道具體是哪一年。matrix系統始終在原地轉圈，既解決不了作為百分之一存在的系統不穩定因素（自主意識過強的人類），也消除不了作為哥德爾命題存在的救世主（尼奧）。
正如莫菲斯所說，命運確實充滿了反諷。當人類目空一切地自以為能夠掌控世界的時候，卻沒有意識到自己制造的人工智能正在成為自己的掘墓人；當機器成為新的統治者、卻在為自身進化陷入死循環而焦頭爛額的時候，卻意外地發現，進化之路的鑰匙原來就在被自己評價為低等生命、作為能量來源而進行批量豢養的奴隸——人類手中。機器的本質是一系列的代碼和數字，是無窮的是非判斷；無論物理架構還是邏輯思維，人類都望塵莫及。但是，人類有情感，有智慧，有豐富的創造力，人類的感性思維和潛藏在骨子里的反叛精神就是生命產生突變的最好土壤。即使只是從數學上講，機器也不是什麼東西都能學習的。人的思維是一個vcdimension無限的函數集。因此，從數學上說，計算機要完全仿真人類思維是做不到的︰不論運算能力多強，也不能在全部函數定義域一致收斂。所以錫安必須存在，機器必須和人進行交互，讓一部分人有自我獨立的思維，通過這些思維升級程序的邏輯，並且利用救世主帶回代碼置入源程序，升級matrix。
也就是說，錫安這些具有自由意志的人類，對于機器的關鍵作用，怎麼形容都不過分。換位思考一下，這樣一個極端重要的、關系到自身進化的存在，會任由他處在無法控制的狀態嗎？而對于機器來說，最好的控制是什麼？還有比虛擬世界更讓人放心的所在了嗎？只有虛擬空間里的行為才容易被記錄和控制，機器的優勢就在于這種成體系的精確性。如果是真實世界里的各種現象，尤其是涉及到人類高度私密性的情感活動和非理性行為，機器要系統地記錄下來和分析研究，何其難哉？
在這種情況下，既然機器能夠創造出第一層matrix，為什麼不能創造第二層matrix？
當然，王楊說這些，純粹只是為了安撫尼奧。以尼奧現在的精神狀態，想要讓他突然全盤接受這一切太困難了。因為這意味著他之前的一切都被否定了。從一個高級程序員搖身一變，換上了為解放全人類而奮斗的鋼鐵戰士的馬甲，這個反差太大了。想要在最短的時間內讓這只菜鳥接受現實，最簡單有效的方法就是給他描述一個更加嚴酷的現實。