第336章南征北戰（一）整編
萬歷四十六年四月底，中華軍北線部隊撤離京津衛地區。五月初，中華軍撤離蓬萊水城，但依舊佔據了遼東半島南部的金州、旅順地區，以及渤海灣中的島嶼。
當月，大批徐鴻儒白蓮教造反軍進攻曲阜，被官軍打敗後，大批逃難者逃向山東與南直隸交界的日照臼港沿海，中華軍水軍北方艦隊第三分艦隊押運大批貨物路過，毅然靠岸接應，救走了五千余難民。
明朝廷言官指責中華軍破壞和議，被方從哲鼓動浙黨、楚黨強力把這股批評風潮壓制下去。同時，方從哲發信催促徐光啟迅即與中華公司當成和議。
六月底，大明朝廷與中華軍總統領尹峰簽訂秘密的和平條約。同時，內閣首輔方從哲在朝堂之上宣讀了一份公開的、雙方主持談判者親筆簽署的《南京協約》︰中華公司向朝廷獻版籍歸降，推出兩京所有佔領區。同時，朝廷開海禁，允許中華公司經營海外貿易。在公開的宣傳中，方從哲有意忽略了關于除南京外的江南佔領區的問題。
在雙方密約中，方從哲準許中華公司的商人享有特許經營權，除按章納稅外，官府不再會對他們進行和買、強行捐納等。而且，關于尹峰稱王的要求，方從哲通過徐光啟，含混地答應會為他爭取。
尹峰在與朝廷後期的談判中，也不再強調封王一事，只要讓他佔據江南這塊地方就行，無需說明名義上的東西，他只要實實在在的利益。
中華軍撤離南京，同時從安慶、蕪湖等地撤離，也從江北的揚州一帶撤離。但是，中華軍繼續佔領者吳淞口，從南京東面的句容往東南，金壇、溧陽直到太湖北岸，這一條線以東，中華軍繼續控制著。中華軍倒是從蘇州府撤出了，但是他們就在蘇州府城以北建築了一處炮壘。太湖以東的昆山、青浦、金山，都有中華軍駐守，並且利用本地四通八達的水上通道，建立了嚴密的水上巡防制度。在江南控制區，中華軍駐扎了新編成的第四師一萬五千人，協同兩支分艦隊五十余艘炮艦戰船，包括配炮七十五門的飛龍號主力艦。
第四師的兵力，一半是麥德第二師的部隊抽調的，基干兵力就是參加南線戰斗的第二師第七團，其余的是由原屬台灣駐防軍的莊丁隊整編而來，還有就是海南土著營及本地招的少量輔助兵。第四師師長由麥德擔任，第二師師長轉由楊大成擔任，將移鎮北方琉球群島，訓練最近從華北、山東、遼東等北方地區招收的北方新兵，這些新兵和原第二師的成員，以後將主要在北方作戰。
麥德出戰的次數不多，原第二團「烈風團」的骨干已經分散到了第二師和第四師等好幾處，但是他訓練部隊按部就班、一板一眼，絕無松懈，因此他的部隊一直是紀律嚴明的強軍。他本人以穩重著稱，主動出擊精神不夠，但是守御有方、臨戰決策果斷，而且他為人和善、善于和人溝通。這一點很重要，因為，中華軍的江南控制區大總管是陳衷紀，副總管曹泰，都是和麥德一樣，是尹峰親手締造的中華軍中第一批將領。
大明朝廷急著要對付東北的危機，中華公司急著要對南洋全面動手，雙方這才達成了那份荒唐的協約，一份亙古未有的，朝廷和商人叛亂分子的和約。
顏思齊的第五旅是最先撤離江南的南線參戰部隊。他們坐上船一直南下，穿過台灣海峽，掠過呂宋以西洋面、在西婆羅洲南崖州靠岸後，接受了本地駐防軍-金礦護礦隊十六個哨隊的兵力，完成整編後，第五旅共有四個團六千余人。其中，第四團的一個營長是全中華軍最年輕的營長，名字叫鄭芝龍，今年16歲，實際上還未完成軍校指揮科的學業。
第五旅的行軍和整編都是非常倉促的，其原因就是南洋戰亂又起。
趙宣明的南洋旅需要防守的地方太多了，除了西婆羅洲、還有蘇拉威西島、蘇門答臘、帝汶爪哇等各中華殖民地需要防守。他的部隊老底子是守澎湖風櫃尾寨的第四團老兵們，如今大量的內地移民、南洋華僑子弟加入部隊，原先那種堅忍的「鐵壁團」作風雖然有些稀釋，但是基本功還在。南洋殖民地駐守部隊的根本問題也在這里，善于防守、不善于進攻。星羅棋布的殖民地駐防堡壘使得南洋旅兵力分散，除了爪哇的井里汶城南洋旅總部，趙宣明直屬的一個團1000余人是戰略機動部隊外，其余部隊分散在各殖民地，戰線拉得太長。
由于國內戰爭的原因，第三艦隊-南洋艦隊還是抽調了一些艦只北上，去支援台灣和南線部隊。中國國內在打內戰的消息也傳開了，南洋的中華公司兵力空虛，這是毫無疑問了。荷蘭、法國、英國以及各南洋土邦都動了心思，開始乘火打劫。
葡萄牙人如今只能靠中華公司的幫忙才能維持澳門的經營，而且葡萄牙人和荷蘭人積怨太深，因而此次南洋危機他們和中華公司站在了一條線上。
荷蘭人聯合英國人、法國人即將在南洋動手的消息，在半年前就通過澳門葡人傳到中華公司商情部。兩個月後，隨著西南季風回來台灣的中華公司商船，陸續帶來了爪哇、亞齊、馬六甲等各處南洋戰略要點全線開戰的消息。今年來台灣的荷蘭商船和英國船減少了很多，這也證明了局勢的緊張程度，大約有四十多艘中華公司商船在巴達維亞、泗水、蘇拉威西、帝汶被扣押。
英國人和法國人都是南洋這盤棋局上的後來者，和葡萄牙人、荷蘭東印度公司、中華公司曾經打過一陣混戰。他們乘著中華公司和母國打內戰，想要改變棋盤的局面。
尹峰是絕不會允許這樣的情況發生。南洋這塊地方，華人是最早的殖民開拓者，只是因為沒有國家為後盾、力量松散和內訌太多，才會在後世被西方人全盤控制。即使是在後世，南洋的經濟命脈八成掌握在華人手中，月兌離了華人的辛勤勞動和貿易往來，所有的西方殖民政府都會垮台。例如，尹峰穿越前的那個時空中，西婆羅洲的金礦產業，是最早的開拓者華人建立起來的。金礦業在華人手中能夠興旺發達，當荷蘭人把蘭芳公司等華人公司趕走後，卻怎麼也沒法經營下去，最後都破產了。一直到二十世紀，西婆羅洲的基礎設施還是華人留下的基礎上建立起來的。
在這個時代，華人象工蜂一樣勞動，西方殖民者和土著坐享其成，這種情況絕不會發生了，中華公司和尹峰的目標是︰把南洋變成中華的內海。
尹峰布置好留守江南的人手後，等不及陳衷紀從北方過來交接職務，就帶著最新的威遠艦和李星的第三師第六旅主力5000人，搭乘海魂、海膽號以及新興號，從吳淞口出發，逆風駛向台灣。
半個月後，他帶直屬親兵營在台北登陸，船隊繼續南下呂宋，去鎮壓那里的倭人、土著人天主教徒叛亂。
尹峰留在台灣，著手開始整編中華軍部隊。
這是中華軍從成立護衛隊算起，第五次整編了，而且還是在戰爭時期進行整編。
尹峰的半吊子軍史專家搞出來的軍隊體制，一開始為了對付西班牙人，模仿的是荷蘭人莫里斯、後期轉向學習後世的瑞典古斯塔夫。隨著燧發火槍的運用，以及軍校教育、自主的火器研發生產體系的建立，現在的中華軍已經發展到開始大量運用大炮、以火力輸出為主、刺刀白刃沖鋒為最後一擊，近似法國大革命前的火器戰術。開得過于超前的金手指，使得尹峰也沒法把握中華軍的一些發展方向了，編制、戰術、士氣、訓練、後勤、情報等各項軍隊要務都處在不停的變化過程中，一切都處在模索過程中。
近期與朝廷的作戰過程中，尹峰發現自己的部隊在擊潰朝廷軍隊方面做得很好，但是按部就班的一字長蛇陣，尤其是橫隊與線式隊形，在擊潰明軍後，卻無法迅速包抄圍殲明軍。所以，中華軍屢屢擊敗明軍，但是以擊潰戰為多，少有殲滅戰，作戰方式比較呆板。
四哨為一個營，四個營一個團，三團為一個旅，兩個旅一個師，這樣的編制在更大規模作戰時，還是顯得很呆板，師長對于部隊指揮，實際上戰術選擇余地很少。在當時通訊條件下，編制太大的部隊，在戰斗時根本沒法做出什麼臨時的戰術調整，只能按照戰前部署打到底，或者就看本隊指揮員的臨場發揮了。可惜，尹峰對于培養這樣的將才和帥才人物，拿不出什麼好得辦法，只能在實戰過程中去發掘這樣的人才。中華軍的軍校教育，現階段能做到基干軍官的養成訓練，培養提高基層軍官的素質，就已經很不錯了。
趙鐵第一師主力除留守遼東半島南部的第二團之外，主力已經全部調回台灣。整編就從第一師開始，但趙鐵有點不滿意，纏著尹峰要求去南洋作戰。