三清山的興衰沉浮，始終與道教的興衰有密切的關系。三清山道教文化開始于晉代葛洪，葛洪在三清山擁有特殊地位。據史書記載，東晉升平年年，煉丹術士、著名醫學家葛洪與李尚書上三清山結廬煉丹，著書立說，宣揚道教教義，鼓吹「人能成仙」，至今山上還留有葛洪所掘的丹井和煉丹爐的遺跡。尤其是那口丹井，歷時一千余載，依然終年不涸，其水汪洌味甘，被後人稱之為「仙井」。于是葛洪便成了三清山的「開山始祖」，三清山道教的第一位傳播者。
唐朝
三清山
道教被朝廷奉為國教，士穿行往返于大江南北，三清山的道教也隨之興盛起來，香火不斷，朝山香客絡繹不絕。唐(周)聖元年(639)年,朝廷為了加強統治，割衢州須江之南鄉、常山之西鄉和饒州弋陽之東鄉，設玉山縣，遂將三清山劃為玉山縣所轄。其後，方士將化緣所得，在葛洪結廬煉丹之處營建了三清山上第一座道教建築——老子宮觀，進一步鞏固了三清山在道教史上的重要地位。
北宋
寧真宗篤信道教，奉老子為太上老君混元上德皇帝。此時，在三清山一帶開始出現成批的道教建築。方士們為了紀念葛洪開山之功，在山上建起了葛仙觀，內中供奉葛仙翁和李尚書石像；同時建起的還有福慶觀、靈濟廟。尤其值得一提的是，方士們在天門峰的懸崖之上，用天然花崗岩雕干砌成一座六層五面的風雷塔，此塔歷盡千年風雨，至今巍然不動，被譽為三清山上道教建築中的一顆燦爛明珠。
元時
朝廷把道教當作控制漢民族的思想武器，道教進一步受到重視。此時三清觀內出現了信奉全真派的方士(出家),他們專門從事道教活動，多時達幾十個人；更多的方士則信奉正一派派(不出。家)，他們受道教經典戒規約束，諳熟各種醮禱儀式，在民間從事道教活動︰一為從事陰事，超度亡靈，如做功德、關殮等；一為從事陽事，如打醮等。據元人魯起元在《游三清山記》中說,此時三清山正在大動土木，擴建三清觀。觀內供奉石刻石仙君、葛仙翁、李尚書、金童、玉女、潘元帥神像；山上景物、地點也以道教稱謂命名，如仙人橋、雷公石、判官石等等。
明朝
明太祖朱元璋特別推崇道教，張天師為全國教主，貴溪龍虎山遂成為全國道教活動中心。三清山距龍虎山僅300里，近在咫尺，傳教、化緣的方士來往頻繁，聯系也極為密切，三清山的教務活動幾乎直接在張天師控制之下進行的，此時山上朝拜之風極興盛，散居于贛、浙、皖、閩的方士和信徒，每年的**月份，都要組織香會「一年朝三清，一年朝少三清山
華」。他們結隊而行，以三清神像和旌旗開道，點燃香燭，抬著豬牛羊各種祭品，並鳴三眼銃助威，配以鼓樂，吹吹打打，浩浩蕩蕩向三清山進發，每日多則上萬人，少則幾千人。明朝為三清山道教活動的鼎盛時期。山上的道教建築也如雨後春筍般大量出現。至景泰年間，山上已經建起龍虎殿、方士羽化壇、玉零觀、糾察府、演教殿、九天應元府、潘公殿、方壕上、天門石坊、飛仙台、流霞橋、石階「眾妙千步門」、「沖虛百步門」等建築，並重建三清觀，改建三清宮。明代的宮宇建築十分獨特︰前後兩進，坐北朝南，以山上花崗岩雕鑿干砌而成，石梁石柱,四周配以石牆,內供玉清,上清、太清三尊石雕石刻神像130尊，摩崖題刻45處。
三清可是等閑地，巨制隨雲入九天。險徑逶迤接棧道，大峰壁立借霧翻。司春神女應有意，怪蟒出山待客還。遍地青松皆俯首，笑迎四海旅人間。
三清山山體南北長12.2公里，東西寬6.3公里，平面呈荷葉形，由東南向西北傾斜。由于處在造山運動頻繁而劇烈的地帶，因此三清山斷層密布，節理發育，山體不斷抬升，又經長期風化侵蝕和重力的崩解作用，形成奇峰矗天，幽谷千刃的山岳絕景奇觀。三清山東險、西奇、北秀、南絕，美在古樸自然，奇在形神兼備，仙靈眾相，維妙維三清山
肖，邀游于清虛之境，出沒于雲霧之中，古為道家福地洞天。山上奇峰怪石不可勝數，雲霧寶光嘆為觀止，珍樹仙葩世所罕見，靈泉飛瀑與丹井玉液媲美，幽谷溶洞為騰蛟起鳳臥虎藏龍之所。歷代宮觀建築與雄險奇秀的自然景觀融為一體，異彩紛呈，鐘靈琉秀，故有「天下第一仙峰，世上無雙福地」之譽。三清山神奇壯麗的景觀是與適宜的地質、氣候分不開的，是地殼運動對地質作用長期變遷的產物。三清山在地質史上經歷了14億年的滄桑巨變，曾有三次大海侵和多次地質構造運動。第一次大海浸發生于14億年前的中元古界。那時三清山地區的地殼運動正處于「地槽」沉降階段，海水浸沒達4億年之久，沉積數千米厚的雙橋山群的復理式海相碎屑岩，並夾雜有海底火山噴發物。在「晉寧運動」後，才結束了地槽式沉降歷史，地殼開始逐漸回返上升，出水為陸，三清山地區進入相對穩定的「地台」階段。此後地殼仍有升降，只是沉降速度和緩，範圍廣闊。在距今6億年前的震旦末期，發生第二次大海浸，海水浸沒達1.6億年之久，一直延續到奧陶紀末期，沉積4000多米厚的淺海相砂頁岩和碳酸鹽岩類，並含有三葉蟲、筆石和海綿等海相古生物化石。以上兩次大海浸，曾使三清山本部變成一片汪洋大海。後經奧陶紀末期的「加里東第一幕」造山運動，三清山從此完全月兌離海水環境，不再接受沉積。在距今4.4億年前的志留紀早期，雖發生第三次大海浸，但海水僅到達三清山東南角的邊緣部分。直到1.8億年前，侏羅紀晚期與白堊紀，三清山區域內發生異常強烈的造山運動，即燕山期運動，並伴隨有大規模的酸性岩漿浸入活動，從而奠定三清山構景的地質基礎。在距今二三千萬年前的年代里，相繼發生喜馬拉雅期的造山運動，即新構造運動，山岳大幅抬升，伴隨水力侵蝕作用的強烈下切，使地勢高低差懸殊。由于三清山的地質環境正處于造山運動既頻繁又劇烈的地段，所以斷層密布，節理發育，尤其是垂向的斷層和節理特別發育。山體不斷抬升，長期風化侵蝕，加上重力崩解作用，形成了峰插雲天，谷陷深淵的奇特地貌。三清山風景區的形成，可說是天工造物，大自然的杰作。
主要景區
三清山十大景區︰1、南清園景區；2、三清宮景區；3、玉京峰景區；4、西海岸景區；5、東海岸景區（陽光海岸景區）；6、萬壽園景區；7、玉零觀景區；8、西華台景區；9、石鼓嶺景區；10、三洞口景區。
重要詩詞
蓬萊疊翠、萬笏朝天；玉女開懷、仙翁現陽；老道拜月、葛洪擎丹；猴王獻寶、神龍戲松；風雷晨曦、西海晚霞。三清山三大絕景︰東方女神巨蟒出山觀音賞曲
東方女神
位于南清園東北，金沙索道上站上方，為三清山標志性絕景。原名女神峰，又稱司春女神，海拔1180余米，通高86米。整座石峰造型就像一位秀發披肩的端莊少女，天設地造，鬼斧神工，惟妙惟肖。億萬年來，女神端坐山巔，默然注視芸芸眾生，神態祥和。世人認為她是東方聖神，春天的化身，因而稱之為「東方女神」。東方女神與巨蟒出山左右相向巋然屹立，象征宇宙天地陰陽和諧，三清仙道天人合一，驚世絕配無與倫比。
巨蟒出山
位于金沙索道上站上方，南清園游步道東北關口處，三清山絕景之一。海拔1200余米，垂直高度128米，是由風化和重力崩解作用而形成的巨型花崗岩石柱。峰身上有數道橫斷裂痕，雖經億萬年風濤雨雪，凜然屹立不倒。頂部扁平，頸部稍細，峰腰最細處直徑僅約7米，狀極突兀，形似一條巨大蟒蛇，破山穿地昂然挺拔而出，直欲騰空沖天而去，故名。此景剛勁多姿，有移步換形之妙，在不同的方位變幻出不同的景像，呈現出「彎刀石」、「仙翁頂仙童」、「白娘子醉酒現原形」、「定海神針」等多種逼真的奇妙景觀。
觀音賞曲
位于梯雲嶺天門群峰之中，由兩座象形石峰一前一後相疊組成。前為老道葛洪像，後為南海觀音像。相傳晉朝葛洪到三清山創道煉丹，感民間疾苦，坐彈琵琶對天傾訴。琴聲感動天庭，觀音順音下凡，合十聆听賞曲，故留此法相于梯雲嶺中，讓高山流水永奏天籟之音。