木葉忍者學校是由二代火影于木葉8年建立的，在木葉12年時才定名為忍者學校。第一屆僅僅只有38人。誰也不想到就是這個小小的忍者學校，卻為木葉培養了無數的人才，木葉也因此被稱為「天才的搖籃」。比如說傳說三忍，木葉八色傳奇，還有後來的十二小強。無疑更是其中的佼佼者。
木葉忍者學校的教育方式與其余四大忍村的方式不同，尤其是采取互相擊殺同伴的畢業考試,而被稱為血霧里的霧隱忍者村。木葉忍者學校的教育方式與木葉的歷代火影的性格有關，雖說忍者雙手都是沾滿血腥，更不要說其中的佼佼者。但木葉歷代火影都是十分重視同伴的人，這也導致了木葉忍者學校的教育十分注重團隊合作。但與岩忍村的那種動輒需要十幾，甚至幾十人大型忍術又有所不同，而是強調各有所長，相互配合。木葉三忍，和後來的豬鹿蝶組合都是木葉教育的典範。
其實千尋瞬也十分慶幸是重生在了木葉，不是因為木葉是後來劇情的發生地，而是因為木葉是鴿派掌權，雖然有團藏的奪權。但權力畢竟牢牢掌控在火影一系的人手中，哪怕將來四代火影戰死，也是三代火影重新出山，而不是團藏成了五代火影。
話說千尋瞬等人跟著海野彥一來到了忍者學校，看著學校的大門，每個人都激動莫名，連千尋瞬也不例外。至少走進這個大門就代表著你有著成為一名忍者的可能。
海野彥一看著身後那些激動的孩子，感慨萬千。當年他這麼大時，也是和這群孩子一樣。他還記得他和他的父親說要成為像火影一樣偉大的忍者，可是因為天賦的問題最後只能當一名忍者學校的老師，他自嘲般地搖了搖頭。
「這里就是忍者學校了。現在我將帶你們去登記入學。」海野彥一笑著說道
眾人跟著海野彥一七拐八拐終于到了一間教室。里面就坐了三個人，也是忍者學校的老師，是負責登記入學的。千尋瞬等人在海野彥一的指導下終于登記完畢。
「好了，孩子們，你們現在已經可以說是忍者學校的一員了。明天九點將舉行開學典禮，千萬不要遲到了啊。明天火影可是要發表講話的，遲到了可是一件非常不禮貌的事啊！」海野彥一提醒眾人道，省的眾人因為太過激動，因為失眠而導致遲到。
「是！！！」眾人大聲答道。
「呦！不錯嘛！很有激情啊。現在原地解散。」海野彥一宣布道
在海野彥一解散後，千尋瞬和水門就來到了新家。說是新家，其實也就是跟以後的鳴人住的地方一樣而已。這里是屬于木葉村公有的，已經在木葉邊緣了。人煙稀少，正好給那些受木葉救濟的人住。水門就住在千尋瞬隔壁。
第二天，千尋瞬很早就起來了。他昨天很晚才睡覺，可是水門更夸張，一晚上都睡不著。千尋瞬是被水門喊醒的，得知昨晚水門激動的一晚上沒睡，他終于抓住了機會狠狠地嘲笑了水門一把。把水門氣得夠嗆。
兩人打鬧了一會才開始收拾，全部都收拾好已經是八點多了。再加上這里離木葉中心的忍者學校有點遠，走的話要將近四十分鐘。于是兩人只能加快腳步，幸好兩人鍛煉過，體質還行。千尋瞬估計，如果是前世的那種體質，早就崩潰了。也不知道這里的人怎麼長的，五歲的孩子比前世成年人還強大。
等到兩人感到忍者學校的時候，已經有很多人都到了，木葉的操場都快被擠滿了。當然，不可能全是學生，家長佔了大部分。兩人不得不站在了最後面。
九點鐘的時候，三代目火影終于到了。不是後來的老頭形象。現在的的猿飛日斬正值壯年，被人稱為「忍雄」。不久前接任第三代火影，更是意氣風發，給人一種不怒自威的氣勢。
「同學們好啊！」剛到門口，三代火影就打著招呼。
「火影大人好。」同學們激動的喊道。
三代火影哈哈大笑，走上前台就開始了演講︰「同學們，歡迎來到忍者學校。這里將是你們作為忍者的開端。我就說幾句，不打擾同學們上課。」
話雖這麼說，可是天下領導一般黑。于是三個大點，五個小點，還有最後一點，開始了。
恩！這是玩笑話，以上內容，純屬娛樂。三代火影果然只說了幾句，勉勵了一番就走了。畢竟剛接任火影還是有很多事要做的，來學校也是硬擠出來的時間。
千尋瞬和水門懷著見到偶像的激動心情，找到了自己的班級。兩人被分在了一個班，都是第二班。兩人來到班級一看，已經有不少人到了。突然，千尋瞬眼前一亮。
美女！不，是蘿莉！好一只小蘿莉，就這麼靜靜的坐在這里，可能是第一次見到這麼多人，微微低著頭，有點羞澀。不過小小年紀，已經有然後美人的模樣。
恩！本著錯殺，不可放過的原則。千尋瞬馬上走了過去，連水門都顧不上。水門模了模額頭，交友不慎，交友不慎啊！
「嗨，你好，我可以坐這里嗎？」雖然是詢問，可是他的動作已經表明這只是禮貌。
「恩！」女孩可能是第一次被人搭訕，臉瞬間就紅了。聲音就像蚊子般大小，如果不是千尋瞬听的仔細，還真的听不到。
千尋瞬剛想乘勝追擊，沒想到一聲大吼將他的計劃打斷。
「安靜！」海野彥一看著眼前大吵大鬧的孩子，拍了拍額頭，他覺得他要頭疼了。
「現在去搬書，自願的舉手！」站在講台上的海野彥一說道。
台下靜悄悄的一片，一只烏鴉在他頭上飛過。
「我！我願意！」
海野彥一向那邊看去，瞬間如泄了氣的皮球。舉手的是坐在千尋瞬旁邊的女孩。對女孩溫和的笑了笑，說道︰「這位同學不錯，不過我覺得這種事還是交給男同學比較好！」
于是千尋瞬悲劇了，誰叫他離最近呢！將書搬來，發好一切搞定之後已經快要放學了。海野彥一索性就解散了。
所有人都高高興興的回家了。包括累了一天的千尋瞬，因為他已經知道了那女孩的名字。宇智波美琴。還是宇智波宗家的人，爺爺就是宇智波家的大長老。可以說是整個宇智波家的公主。水門也認識了一個新朋友，據說叫千手繩樹。千手家的，還有個姐姐。
千尋瞬剛听到這個名字還詫異了一會，不會就是「公主」綱手姬那個戰死的弟弟吧。
一天就這麼過去了，千尋瞬和水門也開始了在忍者學校的生涯