黃巾軍東線戰敗後，岳飛接任渠帥，統領殘兵屯于陽翟休整，皇甫嵩由于兵力大損，原來的四萬兵馬加上曹操後來的一萬援軍至今只剩了兩萬多人，所以在朝廷未發援兵之前他一時也無力進攻，于是雙方在穎川、陽翟一線進入僵持階段。皇甫嵩雖然損兵折將，但好歹也將黃巾軍打敗，天子念皇甫嵩有功便加封皇甫嵩為都鄉侯。
南線大方張曼成在宛城城下圍困城池一百余天，多次攻城，但由于宛城乃重鎮，城高池深城防堅固始終未能攻克，六月，南陽太守秦頡趁張曼成久攻不下懈怠之機猛攻黃巾軍，亂軍中將張曼成斬殺，黃巾軍改以趙弘為大方，繼續與官軍對抗，並攻下宛城，就此官軍與黃巾軍攻守異位，宛城也陷入僵局。
只有北中郎將盧植在北線屢敗張角，剿滅黃巾軍數萬人，將張角逼回廣宗一線，張角退守廣宗後，盧植便建築攔擋、挖掘壕溝，制造雲梯，眼看便可將城池攻下，可正在這時天子派小黃門左豐到前線視察軍情，有人勸盧植賄賂左豐，但盧植素來為人正直，而且一直對這些宦官就看不起，故此堅決不肯。
于是左豐回到雒陽後，便向劉宏誣告盧植道︰「廣宗賊軍易破耳，然盧中郎卻固壘息軍，似是以待上天誅張角也！」
這一下可觸了劉宏的逆鱗，他最恨的就是張角，恨不得立即就將張角殺掉，听完左豐的回報劉宏大怒，下詔用囚車徵盧植回京欲處以死罪，幸虧朝中多名官員相保才使得盧植免除一死。
而後朝廷改以董卓為東中郎將代替盧植，但董卓抵達後數次進攻張角都被打敗，最終也下課了，隨後劉宏下詔調整各條戰線，使曹操駐守長社，朱轉攻南陽趙弘，皇甫嵩接替董卓進攻張角。
恰在此時，巴郡有一人名為張脩在巴郡造反，張脩以與張角同樣的手段為人治病，只是被治好的人都要出五斗米，張脩自號「五斗米師」
七月，正當朝廷調整前線指揮官無暇它顧之時，張脩率教眾攻打郡縣，並迅速佔領幾座城池，這讓本就在兵力上捉襟見肘的朝廷無可奈何，看張脩折騰的動靜不算太大也就沒理他，而是加緊對張角的進剿，以劉宏和朝廷各官員的想法，只要將張角正法了，黃巾軍必然會因為群龍無首而土崩瓦解。
八月，岳飛終究不是曹操的對手，被曹操尋得時機又敗黃巾軍一陣，雖然死傷不多，但陽翟卻失手了，岳飛只好退守東郡。
朱到南陽前線後，與荊州刺史徐璆及秦頡共一萬八千兵卒圍攻趙弘，但直到八月底都無功而返，這時宦官又開始作祟，劉宏因為急切便想調回朱，幸而張溫上表為朱雋說情道︰「昔日秦用白起，燕任樂毅，皆曠年歷載，乃能克敵。俊討潁川已有功效，引師南指，方略已設，臨陣易將，乃兵家所大忌，宜假以時日，責其必成功也」
劉宏覺得有理這才算罷休，但下死令讓朱雋攻打趙弘，否則治罪，無奈朱雋只好拼命廝殺，好在朱雋平日治軍有方，體恤下屬士卒才未發生兵變。
在官軍強攻之下，黃巾軍軍心大亂，趙弘欲要穩定軍心便身先士卒的在城頭防守，最後死于流矢之下，黃巾軍再次易帥，以韓忠為渠帥。
朱雋用聲東擊西之策，讓部下搖旗吶喊擂鼓佯攻宛城西南角，致使黃巾軍大部全部退守西南，而朱雋自己則率領精銳攻東北，有備算無備之下，宛城被官軍攻破，韓忠只好退守小城安眾，朱雋乘勝追擊將韓忠圍在安眾。
皇甫嵩被調到廣宗後，依然實施盧植曾經的策略，並向朝廷增要了援軍，使得張角再次陷入困境，自此黃巾軍主要的三條戰線均陷入僵持，各地小股黃巾軍在失去張角的統一領導後，開始失去紀律和理智，慢慢的向著「蝗蟲」的方向發展，這些小股黃巾軍每到一處就像強盜一樣，不僅針對當地的豪族，同時也開始向平民舉起了屠刀，就此黃巾軍開始失去民心，各世族豪門組織的私人武裝逐步壯大，開始逐一剿滅這些小股黃巾軍。
九月，張角突然患病，身為半個大夫的他知道自己恐怕熬不過這個冬天了，看著自己的兩個弟弟，他心里甚是不安，他知道一旦自己有個三長兩短，自己的這兩個弟弟是無法完成自己的志向的。
患病期間，他也陸續知道了一些別的戰場的消息，知道很多自己早期的弟子都被殺了，黃巾軍正在走向滅亡，想到自己憧憬的太平社會，張角不由想起了劉睿，想起了劉睿曾對他說過的話，心里不禁傷感，雖然自己已經很努力地去避免一些事情，但是最終的結果還是被劉睿說中了，自己領導的太平道如今已經變成了百姓都痛恨的存在，而這個世上恐怕只有劉睿一人才真正了解自己的理想，也只有這個人的理想最接近自己的所期望的未來。
于是，他將身在廣宗的弟弟張梁以及各心服弟子招致病榻之前交代道︰「我之大限已近，今有一事交
代與爾等，我太平道自創立至今已十余載，深得百姓愛戴，十余年間教眾遍布青、徐、幽、冀、荊、揚、兗、豫八州。信仰者或棄賣財產、流移奔赴，填塞道路，至起事之時徒眾數十萬人，可如今由于我等謀事不周，各地宵小冒充者亦是無數，乃至我太平道聲譽受損，各地百姓對我等深惡之，觀如今局勢我等之敗乃成定局，我去之後爾等切記事不可為時便及時收手，帶教眾去涿郡投一人，此人便是那涿郡劉睿劉子聰，若言天下有一人真心為百姓者便必是此人，其義弟公孫瓚如今官拜征北將軍，有此人在我想爾等可無性命之憂矣」
張角說完，眾人皆落淚，看著張角蠟黃消瘦的面龐眾人知道，張角恐怕真的要挺不住了，張梁擦了擦淚水對張角道︰「大哥之言差矣！大哥有靈藥在，病情定然能夠好轉，再者那公孫瓚滅我十余萬教眾乃我等仇敵，我等又豈能前去投他哉？」
張角听完不禁暗自搖頭，他最怕的就是自己這兩個弟弟，他早就才到這二人不會輕易听自己之言前去投劉睿，無奈張角不再說此話題，又說了幾句別的事情，便以巡防為由將兩個弟弟以及幾個頭領遣了出去，只留下了自己的兩名心月復弟子杜甫和大方馬元義。
張角對馬元義道︰「元義，汝跟隨我有十余年，我對汝甚是放心，子美雖隨我僅兩年，然卻為人機警心地善良，可當大任，方才我之言恐怕我那兄弟定然反對，故我將汝與子美留下是想汝二人答應于我，定要盡力將我太平道教眾多帶出廣宗一些，盡可能多保住一些人之性命」
二人流淚點頭答應，尤其是杜甫，他在張角身上看到了劉睿的影子，這二人同樣有著一顆為了天下百姓的拳拳之心。
十月，張角因病離世，年僅四十八歲，張角一死廣宗一片哀號，皇甫嵩確認張角已死後，猛攻廣宗意圖借張角之死群龍無首之時拿下城池，可是奈何張梁接著張角新喪挑動起了教眾對朝廷官軍的仇恨之情，黃巾軍在他率領下英勇的狙擊了官軍的攻勢。
第二天，皇甫嵩關閉營門，讓士卒都休息，以讓黃巾軍松懈，經過前一日的戰斗，黃巾軍的氣勢已基本平復，繼之而來的便是對未來的恐懼，張角在時他們有精神領袖，可是此時他們的信仰已經沒有那麼堅強了，所以逐漸松懈下來。
皇甫嵩看到目的達到，便連夜部署人馬，在凌晨公雞剛剛報曉之時急速沖殺而去，這一戰打了將近一整天，黃巾軍大敗，張梁也英勇的戰死了，此戰黃巾軍死傷兩萬余人，由于有馬元義和杜甫的原因，黃巾軍才避免了更多的傷亡，二人引黃巾軍敗軍開始向涿郡撤退。
亂軍中，張角尸體未能被帶出廣宗，于是遭到了亂刀分尸的下場，張角頭顱更是圖上石灰被送到雒陽，劉宏見到張角之頭欣喜若狂，對皇甫嵩大家贊賞。
隨後十一月，皇甫嵩又在下曲陽大敗張寶，張寶被殺，黃巾軍教眾被殺被俘者達到十余萬人，由于缺乏糧食，皇甫嵩欲按朝廷律法全部將這些人處死，可是此時天子卻派左豐前來，將俘虜的黃巾軍全部押解走了，後來皇甫嵩才知道，原來這些俘虜全被天子賣予了一名人口販子，因此天子得了幾千萬錢。
不過劉宏倒也沒虧待皇甫嵩，任皇甫嵩為左車騎將軍，兼冀州牧並封為槐里侯，食邑八千戶，比公孫瓚少了兩千戶。
張寶也戰死後，皇甫嵩暫時失去了廣宗逃走黃巾軍的蹤跡，便上報朝廷，北線之亂業已平復，劉宏下詔命皇甫嵩帶軍直奔南線，支援朱雋。
二人合兵後，黃巾軍南線渠帥韓忠再也支持不住，大敗而逃，但不幸未能逃出被官軍斬殺，黃巾軍敗兵逃往安樂，後推舉蘇軾為渠帥，因為蘇軾在皇甫嵩未到之時便勸說韓忠棄安眾而走，但韓忠未听最後落得身死，所以逃出後黃巾軍中知道此事的中上層將領便共同推舉蘇軾為渠帥，而這個蘇軾便是無間道計劃的一名臥底。
恰好皇甫嵩的到來也帶來了張角三兄弟的死訊，蘇軾接任渠帥後正是黃巾軍上下毫無戰心之時，于是他借機說動中上層將領，開始向東北撤退，意欲同穎川的東線黃巾軍會師。
皇甫嵩和朱雋看出黃巾軍意圖後，並未阻止，他們想在穎川伙同曹操將黃巾軍一網打盡，所以只是在黃巾軍隊伍後面遠遠地吊著。
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