由于监狱被劫，这无疑是向学园都市宣战。警卫员开始全面出动寻找犯人，根据那名逃出来的狱警描述，犯人正是无能力集团的首领：蛇谷次雄。可是自从上次镇压无能力集团后，蛇谷次雄就已经销声匿迹了，没有人知道他在哪里。警卫员再次赶到曾经的大本营时，已经是空空如也。因此调查陷入僵局。还有就是寻找那名失踪的人，也一样没有留下任何线索，正当寻找还在继续时，新的事情又发生了，又有将近三十人无故失踪了，一点失踪的痕迹也没有留下。而且接下来几天也是接二连三地发生同样的事情，虽然警卫员已经加大了监察和寻找力度，但失踪人数依旧在不断增加。
由于警卫员人数来不及，所以风纪委也是参与进来。黑子和初春每天都忙地不可开交。美琴倒还比较空闲，于是像老样子打算去便利店看免费的漫画杂志。美琴慢慢地走在路上，她发现，路边的行人谈话的主题差不多都是最近发生的人口失踪事件以及之前的监狱事件。美琴虽然也很在意，但却是故意装作毫不在意的样子。
“呱呱呱”美琴口袋里的电话响起了，拨通电话，那头传来了冥土追魂的声音：“那个，你要是有空来一下我这里，研究有结果了。”美琴挂掉电话，直奔冥土追魂所在的医院里。
“砰”医务室的房门被粗鲁的打开了，美琴喘着粗气看着正坐在凳子上的冥土追魂。冥土见美琴这么快就赶来了，也是微微一笑：“看来你对这件事情真的是很关心在乎啊。”美琴缓了口气，问：“医生，研究结果怎么样？”冥土看了看美琴，叹了口气，说：“结果是有了，可是具体的原因还是不清楚呢。”
美琴被冥土的话愣住了，什么叫有结果却还是不知道具体原因？正当美琴打算继续问时，冥土先开口了：“你知道染色体吗？”。美琴一愣，初中的她虽然听说过染色体，但却没有真正认识染色体，所以只能摇摇头。冥土慢慢说道：“所谓的染色体，就是指细胞核中载有遗传信息（基因）染色体的物质，在显微镜下呈圆柱状或杆状，主要由月兑氧核糖核酸和蛋白质组成，在细胞发生有丝分裂时期容易被碱性染料（例如龙胆紫和醋酸洋红）着色，因此而得名。它是遗传物质—基因的载体，控制人类形态、生理和生化等特征的结构基因呈直线排列在染色体上。简单说就是能决定人大部分的机能。当然包括无能力者和肌肉萎缩症等。”
美琴思维转得很快，赶忙说道：“那医生你的意思是那块石头中能改变染色体的能力？”冥土点点头，：“确实是这样，我通过研究发现石头中有一种神奇的能量，这种能量能够补齐或者改造染色体中所含的一切东西，就像修理坑坑洼洼的马路一样，重新平坦。”“那就是说以后这样的绝症都能医治了？”美琴欣喜地问。
可是，冥土却又摇摇头：“很可惜，虽然我知道有这么一种能量，却不能制造出相同的东西，因为我从来没有发现过这种能量，应该是没有人发现也不可能会被发现的一种能量。因为从科学上讲，这种能量不可能会存在于这个世界。”美琴不禁奇怪，问道：“那这到底是一种什么样的能量呢？”
冥土看了看她，说：“生命是由很多的元素加上大量的连科学都无法探清反应后，才产生了生命这种东西。但是我所说的这种能量，只要将它注入到任何一种东西，记住，是任何一种，连石头，机器都行。只要注入，那么那样东西就会拥有生命，变成一个只有外形不一样的生物。简单说，就是被赋予了生命，变成了一个活物，而且如果这样东西原本就有生命，再被注入这种能量，那么这种能量将覆盖在原本的生命上，形成一个完全不一样的新的生命。”
美琴被冥土的话给震惊了，一时间竟然呆住了。冥土看着美琴的反应，也是无奈地笑了笑：“觉得不可思议是吗？其实当时我也是被震惊了，很难接受这个事实。但慢慢地，我接受了，并且给这样的能量起了一个名字：生。”
“生”这个字在美琴脑海中炸开。她回想起曾经听到过的不知道是谁说的话：“可恶，要不是担心索菲亚发现，哪会让你们这么轻松就把“生”给抢回去，不过算了，反正计划已经开始了，就让“生”再潇洒一段时间吧，给我记住，“生”是我们的东西，我们会夺回她的。”
“到底是怎么回事？”琴心中非常混乱：“所谓的生到底是什么？那时我们只是救了雪米妮，那些人的目标也是雪米妮，泪子又说雪米妮是和索菲亚一起逃出来的？难道…”一个惊恐的答案在美琴脑海中爆炸：“雪米妮就是生，那股能量是从雪米妮身上得来的！”
美琴身体不住地颤抖着。冥土奇怪地看着美琴，问道：“没关系吧？”美琴被冥土叫醒了。忍不住深深地吸了口气，说：“没关系。”
冥土也是松了口气，但接着似乎又想到什么，说道：“但是研究还不只这一点。”美琴立刻盯着冥土，追问道：“还有什么发现？”
“经过研究，我发现石头里不是只有“生”这一种能量，还有一种也是说不出的能量，这种能量似乎没有什么特效，但它却能控制“生”这种能量，或者说囚禁“生”，让“生”这种能量听它使唤。”
美琴瞳孔猛然紧缩，大声问道：“具体是怎么回事？”冥土先是被吓了一跳，但很快冷静下来，慢慢说道：“简单说，就是能控制一切有生命的东西，控制他们的机能，新陈代谢，甚至是思维。如果说“生”是部下，那这种能量就是司令，统帅一切属于他的部下。”
美琴的瞳孔都缩至针眼大小了：如果是这样，那么向许愿石许愿的人们体内都有这两种能量。那么如果说“生”是雪米妮的能量，那么另外这种能量难道也和“生”一样是某个人的能量。那么既然这种能量可以操控“生”，也就是说它同样也可以靠这样来操控这些向许愿石许愿的人，那么那些失踪的人难道…
想到这里，美琴赶紧拨通了初春的电话：“初春，帮我查看下失踪的人是不是大部分曾经都是无能力者或者低能力者，然后忽然之间变成能力者的？”初春被美琴着急的通话给吓了一跳，然后赶忙打开电脑查找：“却实是和御坂学姐说的一样，失踪的人大部分都是这样的……”
还没等初春通话完，一名护士着急地跑了进来：“不好了冥土医生，街上有很多人倒下并且失去意识了。”“什么！”冥土大吃一惊，赶紧跑了出去，美琴也是跟了出去。
果然，在大街上到处都躺着失去意识的人。警卫员和医生正在抓紧时间抢救。美琴也是帮忙。忽然，她发现地上躺在一名像是打工仔的人，身上有一股淡淡的咖啡香味。美琴走进一看，居然是那天看到的那名在咖啡馆打工的人。“这人本来是肌肉萎缩症患者，可是通过许愿石，他康复了……慢着，许愿石！”
美琴忽然想到了这个，然后又猛然想到什么，飞快的跑走了，美琴跑去的方向，正是佐天泪子和初春饰利所居住的宿舍的方向。
……
在泪子居住的房间里，泪子昏倒在地上，茶水撒了一地，看样子是刚好在端茶。一旁的雪米妮正流着眼泪拼命地摇着泪子：“泪子姐姐！泪子姐姐！”就在刚才，泪子忽然就倒在了地上，并且失去知觉。
……
……
一道黑影站在一根充满绿色液体的柱子前，看着液体中间的黑色小石头缓缓变大，忍不住大笑起来：“哈哈哈，计划开始咯。”