小五郎也大叫，“我不吃这一套！”三上村长走向外面，显然他没有听过千钧的名声，“联络船要是没有我的许可，是不可能发船的。我看今天晚上，你们好好考虑一下，哈哈……”三上离开后，毛利侦探非常气恼，“可恶！”小兰有些紧张，“看样子我们好像到了一个不讲理的地方了。”晓月哼了一声，“在海上，没有人不讲理能超过海军部那些家伙，对吗，千寻？”千寻露出狐狸一般笑容，“爷爷昔日手下的那些海上自卫队的朋友们，最喜欢干的事情，就是无故拘押船只，不听话的岛屿片板不让下海。”柯南立即明白了，“喂喂，你们不会打算找……”千钧大笑，“这就叫恶人自有恶人磨！这个村长明显不安好心，他要敢鼓动村民袭击我们，我就把他宝贝女儿抓来做人质。”
千钧起身离开，说要去做些准备工作，“我可不想大家步上水军教授的后尘。”千寻用手机打通了爷爷的电话，千水一木问清了岛屿的所在，“好了，你就等好消息吧，海军自卫队的人早就想找点刺激了！到时候，我让他们顺道把你们接回去。”晓月犹豫了一下，觉得还是不要通知目暮警官他们了，警察系统和海上自卫队系统毕竟相差较大，万一闹出矛盾就不好了。
说话之际，木下五郎推门进来，“真对不起，我们村长之所以急着想把金块找出来，完全是希望把小岛变成观光胜地。”晓月冷笑，“观光胜地和金块完全是两码事，村长根本是想独吞。”小五郎忽地站起来，“真是受不了了！”木下五郎急忙道，“请你们放心好了，我明天就安排船只把几位送回本土去。不瞒几位，小型的渔船我还是可以安排到的。”小兰大喜，她早就不想在这个有水军作祟的敷岛待下去了，“太好了！”毛利侦探拒绝，“不行，我现在还不能走……”小兰急忙劝解，木下也道，“毛利先生，你不要这么说，要是再待在这里，你说不定会发生危险的。”
小五郎生气，“我要是这么走了的话，那我天下闻名的侦探毛利小五郎的名字往哪里摆？”柯南大叫，“说的好，叔叔！”木下五郎失望地离开了。柯南急忙追出去，询问浜田的情况，木下说浜田原本不是小岛上的人，是在龙神号事件之后，就突然出现在岛上，声称想找个工作，那个时候灯塔守卫的工作刚好没人做，他就留了下来。木下疑惑，“小弟弟，浜田有什么不对吗？”柯南急忙说没有，“我只是觉得他有点怪怪的。”说完，柯南喊了声再见跑回去了，木下却露出古怪的笑容。
晚上，大家准备休息了，发现千钧到外面后一直没有回来。不过，大家都没有替他担心，能够伤害到千钧的人非常罕见。不久后，大家都进入梦乡，深夜中，小五郎还在梦中念叨着冲野洋子的名字，小兰也睡熟过去。晓月和千寻也在里屋安静入睡，柯南悄然离开，来到灯塔下。猛然间后面有人伸手捂住柯南的眼镜，柯南吓了一大跳，回头一看，原来是三上铃。柯南恼怒，“不要吓我，好不好！”三上铃也生气了，“干嘛这么凶，我是看你一个小孩子大晚上出来，所以才想过来陪你的。”柯南发现灯塔下有人开门，急忙拉住三上铃躲到灌木丛后。三上铃趴在柯南怀里，脸色通红，“干什么啊？我们的关系还没到这一步吧！”
柯南彻底无语了，上原康夫从里面走过来，柯南急忙示意噤声。上原离开后，柯南和三上铃进入灯塔下面的房间，里面乱成一团。柯南道，“原来上原到这里搜东西。”随后柯南闻到汽油味道，发现油桶却很轻，岛上又没有摩托车和汽车，柯南点头，“目标果然是大叔。”柯南听到动静，向灯塔上方跑去，三上铃大叫，“柯南，你不要乱跑啊！”紧跟着追上去。到了灯塔顶部，柯南发现了架子上的长筒望远镜，“果然，千钧说的没错，白天的时候的确有人在这里监视。”柯南走过去，想跳起来来看看，结果都失败了。
三上铃笑道，“你不用跳了，就算看到也没用。因为那个是对着那座山的，根本没有什么好看的。”柯南疑惑，“太奇怪了吧，照理来说，灯塔上的望远镜应该对着大海才是。这个望远镜怎么会对着那座山呢？”柯南猛然发现架子下刻着字，“龙神号”。柯南立即断定，浜田幸二跟龙神号有关，而且调查龙神号会造成他的困扰，所以他才会对付毛利大叔。柯南回过神来，“糟了，叔叔和小兰他们危险了，偏偏千钧又不在……”柯南急忙向下面跑去，三上铃很生气，紧跟着追上去，“可恶，等等我！”
宾馆，身穿盔甲的武士用脚将轻轻踢毛利侦探，小五郎睁开眼，“干什么啊？”水军武士挥刀砍下，小五郎窜了出去，躲过致命一击。蹲在角落里，小五郎惊恐至极，“你想干什么？”听到声音，小兰睡醒朦胧，从隔壁开门进来，“爸爸，怎么了……啊！”小五郎大叫，“小兰，你们别过来。”晓月和千寻推开发愣的小兰，拿着冷月剑和青冥剑走出来，水军武士立即转身逃走了。小五郎大为愤慨，大喊着追了出去。小兰阻拦不及，晓月发现哥哥还没有回来，千寻也发现柯南也不见了。
小五郎一路紧追，“可恶，这么痛，根本跑不快，千钧那死小子，关键时刻不知道跑到哪里了！”经过一番追逐，武士跑到了码头附近放着龙神号的仓库，毛利气急败坏地追了进去，“这下子，你跑不掉了吧！”然而，武士突然出现在小五郎身后，用刀柄将其击晕。小兰、晓月、千寻走出门外，刚巧碰到回来的柯南和三上铃，小兰很是生气，“你跑到哪里去了？我担心死了。”柯南问出什么事了？小兰露出惧色，“刚才爸爸被水军的幽灵给攻击了！”柯南大惊，这时港口的吊钟敲响了，表示岛上发生了大事。大家一起跑过去询问状况。
接着，大家都来到仓库，外面围了很多人。千钧也从远处赶来回来，听到钟声，也到了仓库这里。晓月和千寻一顿埋怨，千钧笑着解释说等会有好戏看。千钧上前询问，发现一个老警察和2个男子押着小五郎从里面出来。柯南和小兰叫出声来，三上村长也很惊讶，“到底怎么回事？”村民甲说毛利侦探把灯塔守卫浜田杀了。柯南恼怒，“什么？”小兰很生气，“我爸爸杀人，怎么可能？”千钧冷笑，“说话要讲证据的，你们谁亲眼看见了？”大家都是一愣，村民乙说，“你们要不相信，自己看吧！”
大家一起过来，发现身穿盔甲的浜田被人用武士刀贯穿了脖颈，鲜血还在下流。大家的脸色都很难看，年老的驻在警察说，“刚才我追到这里的时候，这个侦探已经昏了过去，而浜田先生就是这个样子了。”小五郎大吼，“真的不是我，你们要相信我。”村民们开始骚动，“太可恶了！”“都是他们这些外来人乱来，水军的灵魂才会生气的。”柯南大急，“叔叔绝不会做出这种事情的，但照这个情况看……”千钧大吼，“不准随便侮辱别人，毛利侦探可是你们村长请来的！”
三上村长却说，“毛利先生，就算你是名侦探，我还是不能看见你杀人而放你一马。”小五郎解释，“我在睡觉时，突然有人模黑攻击我，接着我就追到这里，后来就突然被人从后面打晕了。等我醒来的时候，就是这个样子了。”糊涂警察说，“也许是你搏斗的时候，把他浜田杀了。”小五郎大吼，“我没有杀他！”木下五郎说，“浜田先生这身衣服，不是放在水军资料馆的那副盔甲吗？他怎么会做水军装扮啊？难道又是水军作祟？”三上武男恼怒，“不要在这里妖言惑众！”村民们都相信了木下的话，“一定是这样，水军附在了浜田身上。”村长很生气，“什么嘛，水军作祟根本就是迷信。”村民丙问，“那为什么浜田会穿上这幅盔甲？”
驻在警察说，“现在争论这个根本于事无补。”柯南走过去观看，死者的致命伤在脖颈上。浜田的袖子破碎，手腕上有被帮过的痕迹。千钧走过来，撩开衣襟，“死者身上都是刺伤，看样子被人严刑逼供过。”木下五郎走过来，“小孩子不应该看这些恐怖的东西吧！”柯南答应一声，却跑到龙神号里查看，小兰觉得他太失礼了，就跟上去阻止，“你随便跑进去，人家会生气的。”
千钧却拦住了驻在警察，“请出示你的警察证！根据日本法律逮捕犯人的警察必须随身佩戴证件。”驻在警察有些疑惑，还是拿出了证件，千钧也出示了自己的警务协助证件，解释，“我是东京警视厅特别协助人员，你应该知道，没有人亲眼看见行凶过程，就表示没有人证。单凭主观臆测是不可以逮捕犯人的，只可以请他配合调查！”千钧看完驻在警察的证件，摇头，“警察先生，你的证件都已经过期了，不能证明你的身份了。你没有权利逮捕犯人，也不能以警方的身份调查这个案件！”老警察苦笑，“我快要退休了，这个岛上又没有什么案子，我也从来就没有逮捕过犯人，所以就没有去更换新的证件。”
柯南在龙神号发现了血迹，证实了浜田是在这里被杀的，而且血已经干了。小兰急忙通知了千钧和老警察，二人一起过去观看，警察道，“的确，浜田是在这里被杀的。不过，光凭这点，不能说毛利侦探是无辜的吧？”千钧不屑，“你有没有上过正式的警察学校，学习过警察守则吗？现在的法律是无罪推定，如果没有证据证明毛利叔叔杀人，那他就是无辜的，他不需要提出任何反证来证明自己的清白。”
大家从上面下来，还有村民在喋喋不休地纠缠，因为水军作祟，要求严惩毛利小五郎，木下在旁边劝解，小五郎被逼到角落里。警察大喊，“不要再吵了！”千钧大怒，过去将村民abcdef等人一个接一个地扔了出去，“你们再恐吓当事人干扰办案，别怪我出手无情。”倒地的村民爬不起来，都用惊恐地眼光看着千钧。千寻和晓月一起叫好，“哥哥，太棒了！”千钧哼了一声，“我现在以警视厅特别协助人员身份调查这个案件，请驻在巡查协助调查。任何人干扰办案，我会在事后请他到警视厅喝茶！”
千钧很快就证实了死者的死亡时间，应该在小五郎到达这里以前已经被人杀死了，而死者身上的伤痕证实了，死者曾经被人严刑逼供过，所以凶手不可能是毛利侦探，因为他没有足够的时间，也不认识浜田。“真是笑死人了，一群没有见识的乡巴佬！”三上村长恼怒，“你说什么！”千钧冷笑，“虽然我不知道凶手是谁，但用这种骗小孩子的把戏，来陷害毛利侦探的话，那就大错特错了。”
村民们有些动摇，“难道真的不是毛利先生做的吗？”“当然不是，因为毛利大叔追到这里的时候，浜田幸二已经死了。”村民q大怒，“你少在哪里胡说了，你们是一伙的！”千钧将其揪住来，“你是猪啊，没有亲眼看到的事情，都不足采信！更何况，就算是亲眼看见的也未必是真相！”最有力的证据就是龙神号上的血迹，如果是毛利所杀的话，不会超过30分钟，但机械室里面的血早就干了，至少已经过了3－4个小时了。“我说的没错吧，糊涂巡查！”老警察苦笑着点头，“不错，那血的确有很长时间了。”
千钧继续，“所以攻击毛利侦探的人不是浜田，而是他把浜田杀害后，又换上水军盔甲来攻击毛利叔叔。然后将毛利引到这个地方来，目的是让毛利叔叔背上杀害浜田的黑锅，同时利用了水军作祟的传说。这是36计里面的借尸还魂之计！”大家都相信了，日本人大都熟悉中国传来的计谋，村长有些不服。千钧继续解释，凶手先把浜田绑在机械室里，严刑拷打，证据就是浜田手腕的痕迹和身上的伤痕。“如果凶手想杀他，那他身上的伤势未免太奇怪了，不是吗？糊涂巡查！”
老警察很快证实了千钧的推理，村民们都明白了，“那凶手为什么要这么做？”千钧有些抓瞎了，只好回头求助柯南。柯南苦笑，拿出蝴蝶结变声器，“因为浜田跟龙神号之间有某种关系，恐怕他曾经在上面待过。”三上武男惊叫，“你怎么会知道这些事情的？”“因为灯塔上面有一架龙神号的望远镜。”三上铃奇怪，“怪叔叔，你怎么会知道这件事情的？”千钧吃了一惊，“没有事情能瞒过平成年代的华森医生！”村民q也想起来，“浜田出现在岛上，的确是7年前的事情了。”三上村长也有点明白了，“那凶手想从浜田嘴里套出来的，难道是金块的位置吗？”
毛利小五郎也明白过来，“没错，浜田为了看守那些金块才在这个岛上住下来的，凶手认为浜田很有可能知道金块的藏匿之处，所以才会这么做。”晓月也笑了，“原来如此，所以浜田才设计袭击了毛利叔叔。毛利叔叔突然出现在敷岛，而浜田害怕毛利叔叔找到那些金块，于是就设计杀人。”千寻也点头，“可是浜田从舞台后面出来时，被柯南和小铃看到了。”三上铃得意地证实了这一点。
柯南用千钧的声音接过话语权，“其实岛上还有一个人也在寻找金块的下落，对他来说毛利侦探和浜田都有可能说出秘密，是他的绊脚石。所以那名凶手做出这件案子来就不奇怪了。”地上的村民们逐渐都恢复，爬起来，“可是我们岛上没有这样的人啊！”千钧明白过来，知道了柯南的意思，“对，就是他，从东京来的另外一个人。”毛利侦探也醒悟，“东都旅行社的那个人。”三上铃也说，“我昨天看到他和浜田叔叔见面，二人吵架了。”三上村长很恼火，“木下，他现在住在哪里？”木下五郎说是在民间旅馆。
小五郎的嫌疑彻底洗清了，小兰称赞千钧，“你也很棒嘛，推理太精彩了！”千钧大笑，“这个案子太简单了，根本不值一提。”柯南好笑，“的确是太简单了，也就能骗骗岛上的这些笨蛋。”小五郎大为高兴，现在没有人认为自己是罪犯了。大家约好了，一起去抓捕上原康夫，大家分头包围了旅馆。村民们也都有些害怕，犯人可是很凶残的，“警察先生，你快点进去抓人吧！”老警察腿肚子哆嗦，“这个，我从来没有抓捕过犯人！”村民们头疼，“那你带枪是干什么用的？”
千钧和柯南从后面出现，问他们怎么还不行动？老警察看到千钧仿佛有了底气，“千水先生，现在拜托你了，你也说过，我的警察证过期了，没有抓捕犯人的权利。”柯南汗，千钧头上冒烟，“真是的，刚才抓毛利叔叔的胆量哪里去了！算了，交给我了，我去把他抓出来吧。”木下五郎自告奋勇，“我也一起去好了，希望能说服他自首。毕竟把他请到岛上来的人是我，身为村干事我不能逃避责任。”千钧点头，“这才像个样子，走吧，我们一起过去。”
随后二人一起进入旅馆，柯南等人都留在外面。千钧问，“这家伙住在哪里？”木下说不知道，“里面还有些游客和特殊服务女子，我当时只是安排他住下，没注意他住在哪个房间。现在天色太晚了，接待人员都回去休息了。千水先生，你动作快，到楼上去找，我在楼下找。”千钧点头，“如果那家伙反抗，马上喊我。”随后千钧上了二楼，依次寻找起来，惊醒了不少交颈而眠的男女，引来一片咒骂声，千钧只好低声道歉。旅馆虽然不大，房间却也不少，千钧好不容易快要搜查完了，时间已经过去了5分钟，这时，楼下传来枪响。千钧大惊失色，匆忙跑下去。柯南和老警察他们听到枪声，也都急忙进去支援。
千钧最先赶到，看见木下五郎捂着手臂躺在地上，“木下先生，你没事吧！”木下指着窗户，“被他逃走了。”说话间，柯南他们也都到了。老警察从上面观察，“他逃到树林里面了，快追！”大家分头去追，千钧和柯南扶起木下，木下苦笑，“我本来要劝他自首的，可是他突然用枪射我。”老警察担心，“你得快点到诊所医治伤口。”木下点头，“没有什么大碍，子弹打偏了，只是擦伤。”千钧和柯南都是一愣，仔细看了看木下的伤口，都有些惊疑。
不久后，村民们发现几乎所有的船只都失踪了，除了个别隐秘处留做修理的船只。大家惊骇万分，更加认定是水军作祟。柯南想起千钧晚上出去很久，“喂喂，不是你动了手脚吧？”千钧微笑，“那个我是坚决不承认的。不过，这样也好，大家谁也别想离开，三上武男那个笨蛋还有什么可以值得嚣张的，哈哈……”柯南汗，非常好奇，千钧把这些船都弄到哪里去了，里面不止是渔船，可是还有大型轮船的。