()苏峻闻陶侃、温峤唱义于武昌，用参军贾宁计，自姑孰还据石头城，分兵以拒侃等。又逼迁天子于石头城，司徒王导固争不已，峻不从。
五月乙未，小皇帝悲泣着登上去石头城的车驾，百官随同，宫中无不恸哭。时天大雨，道路泥泞。侍中钟雅、右卫将军刘超徒步侍从左右，小刘屹亦在车驾旁跟随。途中，几个士兵牵来两匹马，言道：
“苏将军有令，两位大人劳苦，特赐两位大人马匹以供路途之用。”
“谢苏将军好意，请汝等回禀苏将军，昔叔齐、伯夷不食周粟而死，超等一介儒生，虽非古之大贤，尚知礼义廉耻。”
刘超言辞悲愤慷慨，坚持不骑。钟雅亦如是，不过回头见浑身满是泥泞的小刘屹，便言道：
“吾等体力尚可，苏将军不必费心。然车后孩童，年幼体弱，如此旅途，恐其不支。皇上平rì甚依赖此子，若其不测，皇上必然大闹，那时我等亦不能劝。”
刘屹听见几人话语，连忙上前道：
“二位大人不必为小儿担心。义父、师父所授忠孝仁义，小子实不敢忘。况我本是平常人家之子，并非金贵之躯。故我虽年幼，亦当效仿二位大人。”
“此子真佳儿也！温太真有子如此，夫复何求？”
刘超言毕，遂与钟雅一起牵着小刘屹随着皇帝车驾前行。来人具以实情回禀苏峻，峻大怒。或有人谓峻曰：
“刘超、钟雅及帝侧数大臣，终不为将军所用，今陶侃、温峤帅军逼于外，超、雅有异志于内，久之，必为祸患。请将军速除之。”
峻虽恶之，然未敢杀也。乃以其亲信许方等补司马督、殿中监，外托宿卫，内实防御超等。
到达石头城后，苏峻以仓屋为帝宫。刘超、钟雅与右光禄大夫荀崧、金紫光禄大夫华恒、尚书荀邃、侍中丁潭侍从，不离帝侧。虽居幽厄之中，超臣节愈恭，犹启帝，授《孝经》、《论语》。
由于石头城附近郡县百姓为躲避战乱，纷纷逃离，使得乡里十室九空，田亩荒芜。而城内驻有兵士万余，又有朝中百官及家属侍从，加上城中谷粮优先供给兵将，遂使城内饥馑，即使是皇帝，一rì之食亦不足半斗。而苏峻依旧嚣张跋扈，每rì来皇帝面前皆有不敬之言。
刘屹依然陪伴小皇帝左右，两人一起共患难半载，感情rì深。而刘屹所得之食不足皇帝的一半，帝于是每rì将己食分于刘屹。其后苏峻见刘超等食物甚少，乃赠其米，意在拉结，而超一无所受。
此时看似毫无所动的王导，密令以太后遗诏谕三吴吏士，使起义兵救天子。会稽内史王舒以庾冰（庾亮之弟）行奋武将军，使将兵一万，西渡浙江。于是吴兴太守虞潭、吴国内史蔡谟、前义兴太守顾从等皆举兵应之。潭母孙氏谓谭曰：“汝当舍生取义，勿以吾老为累！”尽遣其家僮从军，鬻其环珮以为军资。谟以庾冰当还旧任，即去郡以让冰。
苏峻闻东方兵起，遣其将管商、**、弘徽等拒之；虞潭等与战，互有胜负，未能得前。
陶侃、温峤军于茄子浦；峤以南兵习水，苏峻兵便步，乃下令诸将士：“有上岸者死！”适逢苏峻送米万斛馈祖约，约遣司马桓抚等迎之。毛宝帅千人为峤前锋，告其众曰：“兵法：‘军令有所不从’，岂可视贼可击，不上岸击之邪！”乃擅自前往袭抚，悉获其米，斩获万计，约由是饥乏。温峤表宝为庐江太守。
陶侃表王舒监浙东军事，虞潭监浙西军事，郗鉴都督扬州八郡诸军事，令舒、潭受鉴节度。鉴帅众渡江，与侃等会与于茄子浦，雍州刺史魏该亦以兵会之。
丙辰，陶侃等率舟师直指石头，至于蔡洲，侃屯查浦，峤屯沙门浦。峻登烽火楼，望见士众之盛，有惧sè，谓左右曰：“吾本知温峤能得众也。”
庾亮遣督护王彰击峻党张曜，反为所败。亮送节传以谢侃，侃答曰：“古人三败，君侯始二；当今事急，不宜数尔。”亮司马陈郡殷融诣侃谢曰：“庾将军为此，非融等所裁。”王彰至曰：“彰自为之，庾将军不知也。”侃曰：“昔殷融为君子，王彰为小人；今王彰为君子，殷融为小人。”
诸军初至石头，或yù决战；或yù避开石头重戍，，取道丹阳南直插建康，断贼后路，而后围而歼之。众议纷纷，一时不决。
陶侃言道：“贼众方盛，难与争锋，当以岁月，智计破之。”
温峤亦道：“峻军多马，南军杖舟楫，不能轻与交锋。宜筑垒而守之，后伺机而动。”
乃筑白石垒，义军与峻兵数战，互有小胜。