光和七年腊月，南线黄巾军在苏轼领导下与东线黄巾军首领岳飞会师，随后二人立即整顿人马在皇甫嵩、朱隽二人未到之时对曹操大营发动了一次夜袭，虽然因曹操防备周密未能取得实质性胜利，但是却让曹操错误的判断了局面，正当曹操加倍防范，不敢进兵之时，岳飞、苏轼二人却带领二十万黄巾军突然东进，直奔芒砀山而去，曹操发觉后领兵追击，却遭到黄巾军精锐的埋伏，败了一阵，只得回兵。
当皇甫嵩、朱隽赶到时，曹操刚刚败回大营，三人见面后立即商议对策，无奈长途奔波之后，皇甫嵩二人所带兵马也无力追赶，只得让黄巾军逃月兑。
黄巾军入芒砀山之后，皇甫嵩三人暂时失去了黄巾军的动向，只得向雒阳回报，天子刘宏接到战报后大喜，虽然没有彻底消灭黄巾军余党，但是最重要的是张角三兄弟已经死了，黄巾军没有了领袖后，朝廷不再把活跃在各州郡剩余的小股黄巾军当回事。
为了表彰皇甫嵩三人的功勋，刘宏将皇甫嵩的食邑增加到万户，朱隽封为西乡侯，拜镇贼中郎将，曹操升为校尉，随后朝廷下诏改元为中平，并大赦天下。
在朝廷军队与黄巾军大战的时候，西北由于遭灾也发生了叛乱，羌族中的先零部落以及枹罕、河关两地的山贼强盗联合造反，共同拥立湟中的胡人北宫伯玉、李文侯为将军，将护羌校尉泠征杀死，随后用计将金城两位有名的人士骗了过来，这二人便是边章、韩遂，并用二人的家眷胁迫二人一同造反，主持军政事务，二人无奈只得遵从，并按要求将金城太守陈懿杀死，以表决心。
一时间，西北大乱，当时由于与黄巾军交战正酣，朝廷无兵可派，所以对于西北也是有心无力，只能由当地的郡县出兵抵挡，好在汉阳郡长史盖勋为人正直，颇有声望，在他的调节下，各级将领才能同心同德，迎战叛军，冀县一战，边章因敬重盖勋而撤兵，但在救援新任护羌校尉夏育之时，盖勋在狐槃遇敌，结果被羌人俘虏，羌人敬佩盖勋的仁义与勇武，不敢加害与他，还特地将盖勋送回了汉阳，但是官军却损失惨重，无力再与叛军抗衡。如今最大的三波黄巾军已被铲除，所以刘宏立即派皇甫嵩带领三万大军前去平叛。
中平二年正月，由于前一年的连续大战，而当时的人又没有彻底清理战场掩埋敌人尸体的习惯，所以造成了瘟疫，即使在寒冷的正月里，瘟疫还是在各地传播起来，这使得各地百姓更是苦不堪言，到处是染病而死的百姓，活着的更是到出躲避逃难，流民又在大汉土地上形成了。
幽州邻近的百姓由于听闻涿郡太平，而且官府宽容，愿意收纳难民，所以全都争相向涿郡涌来，刘睿作为一个二十一世纪的人当然知道瘟疫的厉害，但同时他也懂得控制瘟疫的方法，所以在贾诩等人提出拒绝难民入境以保境内百姓安全时，刘睿提出了不同意见。
刘睿通过公孙瓒下令，让士卒严把各地要道，设立关卡和周转营，高薪聘请各地大夫到周转营中为难民诊病，凡是逃到涿郡的难民全部需要隔离半个月以上才可入境，并在营中教授百姓良好的各人为生习惯，减少传播途径。
让刘睿万万不曾料到的是，就在他为了诊治难民而到处高薪请大夫的时候，涿郡来了一位自告奋勇而且分文不取的大夫，刘睿深深为此人的高尚而感动，特地前去拜访。
来到一处周转营，刘睿见到了此人，见此人身穿一件蓝色粗布长衫，约有六十上下的年纪，但却是鹤发童颜，一副慈眉善目让人觉得分外慈祥，此时正在给百姓诊治。
来到此人近前，刘睿躬身施礼道：“老丈有礼，在下涿郡刘睿讨扰”
老人听到刘睿之言，回身上下打量刘睿，随后露出笑容，对刘睿说道：“原来是涿郡刘善人，恕罪恕罪，老夫有礼”说着也对刘睿拱了拱手。
刘睿赶忙客气的还礼，并问道：“如今天下疫病流行，人人谈疫色变，奈何睿高金相请，也少有大夫前来应诊，倒是老丈不为财物却无私前来，刘睿万分感激，在此先行替众多百姓谢过老丈！”说着一揖到地。
老人赶忙扶起刘睿笑道：“刘善人言重，百姓该谢者实乃刘善人也！老夫之绵力怎可与刘善人之大义相比，老夫行医一生只为世间能少些病人，至于钱帛皆乃身外之物，老夫并不看重，刘善人不同是如此耶？收留这众多流民所耗之资何其之巨？若非心存善念，心系百姓安危者，绝不能行如此大善之事，老夫此言可对否？”
刘睿忙道：“老丈谬赞，睿实不敢当，未曾请教老丈尊讳是？”
老人道：“哦，老夫失礼也！老夫乃沛国人士，华佗华元化是也！”
刘睿闻听一愣，随后大喜道：“原来是神医华佗！”
华佗被刘睿的表情弄得也是一愣，莫名其妙的道：“神医之称华某绝不敢当，难道刘善人知晓老夫之名乎？”
刘睿这才感到自己失礼，连忙道：“方才睿唐突，华神医莫怪，实不相瞒，睿确是曾闻神医大名，若华先生当不得神医之名，恐怕当今天下也无人敢当也，神医若是不弃，称在下子聪便可”
对于刘睿的一些事迹，华佗也是早有耳闻，所以内心对刘睿也是非常欣赏的，否则他也不会老远的来到涿郡，来此除了尽自己之力拯救百姓外，其中目的之一就是来看看刘睿，若是刘睿为人确如传言中所讲，自己就留下多帮刘睿些时日，若是此人只是沽名钓誉之辈，自己救完人便离开，今日一见刘睿觉得此人气度非凡，而且毫无那种富家子弟凌人的气势，有的倒是谦谦君子之风，所以他对刘睿的印象非常好。
听到刘睿之言，华佗也不客气，对刘睿笑道：“子聪老弟，老夫亦是早闻老弟善名，今日得见当真是闻名不如见面，老夫深感与老弟投缘，故老夫欲与老弟平辈论交可好，以免今后总感见外，若是子聪不嫌我华元化老眼昏花，便称老夫一声老哥可也！不知子聪之意如何？”
刘睿见华佗性情开朗，也不再矫情，便喜道：“华老哥哪里话来，睿怎敢嫌弃老哥，只怕今后睿还要劳烦老哥给睿诊病也”说完二人皆笑。
笑罢，华佗问刘睿道：“老弟，老哥有一事不明，请老弟释疑”
刘睿道：“请老哥名言”
华佗皱眉道“老哥此来路经多处，疫情之重无以言表，使得老哥行程耽误良久，可是到得此处，老哥发现，此处病人虽亦是不少，然其余常人却不似他处，容易被染，后才知晓，是此处守军严令百姓注意饮食，勤加洗手，只喝烧滚之水等缘故也，老哥要问之事便是，这众多方略出自何人之手，以老哥观来，此人也必是行医之人，且其医术必不在华某之下，故老哥欲与之结交，不知老弟可否引见”
听完华佗之言，刘睿身旁的亲卫忍不住，不禁扑哧一声笑了出来，随即感到自己失态赶忙忍住，并偷眼看了看刘睿，刘睿只是看了他一眼并未责怪，华佗看了却觉得奇怪，但隐约也明白了几分，眼中露出疑惑之情，刘睿看华佗眼神知道华佗猜到了一些，他本身也没想隐瞒，而且他自听华佗自己介绍完后，心里就有了一个计划。
于是刘睿道：“老哥内心所猜不错，此法正是睿所传，睿对医术却并不精通，然睿手中确有医道之书若干，此间方略皆是出自那些书籍，若是老哥有兴趣，睿可赠与老哥”
华佗一听，高兴异常，他一生致力于医术一道，华氏家族本是一个望族，其后裔中有一支定居于谯县以北十余里处，风景秀丽的小华庄（今谯城区华佗镇）。
至华佗时，这支华氏家族业己衰微，但家族中对华佗寄托了很大的期望。其名“佗”，乃负载之意，“元化”是化育之意。华佗自幼刻苦攻读，习诵《尚书》、《诗经》、《周易》、《礼记》、《春秋》等古籍，逐渐具有了较高的文化素养。
华佗行医，并无师传，主要是精研前代医学典籍，在实践中不断钻研、进取。当时我国医学已取得了一定成就，《黄帝内经》、《黄帝八十一难经》、《神农本草经》等医学典籍相继问世，望、闻、问、切四诊原则和导引、针灸、药物等诊治手段已基本确立和广泛运用；而古代医家，如战国时的扁鹊，西汉的仓公，东汉的涪翁、程高等，所留下的不慕荣利富贵、终生以医济世的动人事迹，所有这些不仅为华佗精研医学提供了动力，而且陶冶了他的情操。
在华佗二十多岁时，正是汉桓帝之时，桓帝宠信太监，各地叛乱不止民不聊生，王粲的七哀诗中曾有过当时情景的写照，诗云：“出门无所见，白骨蔽平原。路有饥妇人，抱子弃草间
华佗正是在这种环境下成长起来的，他十分同情贫苦的百姓，当时由于百姓贫苦大多数人生病都无力就医，只能硬抗，很多人开始都是一些小病，但因无力诊治最终丢却了性命，华佗于是凭借自己的医术，奔走于大汉这片土地上，用自己的一颗济世之心和一双脚板到处为贫苦百姓解除疾苦。
此时当他闻听刘睿手中有很多医书时，他欣喜异常，因为从刘睿传与百姓的简单消毒之法来看，这些知识起码他没在医书上见过，也就意味着刘睿手中的医书是另一个领域的知识，所以他才兴奋。
随后，经刘睿建议，华佗在营中诊断了十余名病人，确定下药方，刘睿吩咐守营士卒前去准备药物，然后煎好给病人喂服，三日后病人痊愈，这才将药物大量使用，华佗也才随刘睿回到涿县。
回到涿县后，华佗被李家庄的景象所吸引，对刘睿的印象再次加深，在他眼里李家庄俨然就是人间仙境，洋溢在百姓脸上的幸福之情，彻底打动了华佗。
当刘睿将《百草纲目》以及一些西医外科方面的资料整理交予他后，华佗更是被这些书籍资料所吸引，孜孜不倦的学习起来，其实此时的华佗已经开始了对进行外科手术的研究，只是限于条件落后以及观念的影响，具体实施的非常之少，只有在碰到使用常规方法无法医治，必死无疑的病症时，他才会进行外科治疗，正所谓是死马当活马医。
有了刘睿所给的资料，华佗系统的对外科手术等知识有了了解，根据以前自己的亲身接触对照刘睿的资料，华佗对人体有了进一步认识，尤其对什么人工呼吸，心肺复苏等更是感觉新奇，但通过常年行医的老到经验，他深知这些方法绝对是行之有效的。
华佗这一学就是一个多月，对于不能理解的术语句子他向刘睿不耻下问，这一个多月他与刘睿的感情加深不少，而且对刘睿的远大抱负也有了一个了解，刘睿也趁机提出了自己的想法：建立涿郡医学院，让华佗担任首任教授，虽然华佗对这些什么医学院、教授的名词不是太理解，但是刘睿的意思他是明白的，想到经过自己之手，将来从这里可以走出一批批的医道高手，解救天下百姓与病痛之中时，华佗顿时激情高涨，并向刘睿表示，不光他要在此任教，他还要将自己的小友张机请来，与他一起为医学事业做出贡献。
对于张机，刘睿也是非常熟悉，他就是后世称颂的医圣张仲景，他所著的《伤寒杂病论》是自己时空中后世中医的入门教材，听到华佗说要把张机请来，刘睿更是高兴万分，于是在刘睿与贾诩等人商议过后，李家庄外开始动工修建涿郡医学院，而华佗则动身前往荆州去请张仲景，原来张仲景由于避祸已经举家迁往江南，刘睿为了华佗的安全，再三劝说下派了三名亲卫保护华佗而去。
而在华佗学习的这一个月中，张、苏二人更是利用自己的商业系统从各地采买药材运回涿郡，之后将配好的药物再运往各地，对于那些豪门世家便是高价卖出，而对于贫苦百姓则是暗中无偿赠药，使得涿郡周边的州郡疫情很快得到了控制，而且在民众心中对涿郡刘睿的感激之情大盛，这为以后刘睿对这些地区的治理打下了坚实的基础。
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