就在陈雨修整林竹、龙驹、武关城池，安置流民这段时间，朝野之间发生了许多事情。
首先是正月里，兵部职方主事贺王圣，劾温体仁（内阁首辅）庸奸误国。让崇祯发配任地方官去了。
御史吴履中，弹劾温体仁、王应熊并及监视内臣。崇祯下旨责问。
崇祯大概也觉得皇亲国戚太多不干事情白吃饭的。一直想做个有为明君，挽救大明，所以在正月里为此事情下旨：凡郡王子孙有文武才能堪任用者，宗人府具以名闻，朝廷考验，授以职，迁除如常例。
侍郎陈子壮上言：“宗秩改授，适开侥幸之门，乱藩规，混铨政。”这无疑打击了要改革朝政弊端的崇祯，以沮诏间亲，下陈子壮牢狱。
到了第二年四月，才释放了他。可惜这些宗室当官后，并没有如崇祯所想，同一血脉而为大明出力。一个个贪赃枉法，公私苦之。
洪承畴与正月率军赴河南时，各部贼寇往来不定，在豫中月复地，关陕以东，黄河以南，襄阳以北，延袤数千里，所在驰突。使得他四处追堵，穷于应付。
而此刻，破了凤阳的农民军分三路开始四处扫荡。
高迎祥、李自成等率领一军，于凤阳府太和县进入河南。经河南鹿邑、杞县，进入密县山中。
扫地王张一川等率军，攻毫州(今安徽亳县)，走河南夏邑，围归德。
以张献忠为首的部队，则杀入庐州府境内。
正月二十一日，张部至柘皋劫掠。流寇汹涌而来快进入县境时候，有难民奔走告知知县严某。这个平时只知道搜刮民脂民膏的无能之辈却不信，对报信人说：“不过是小股盗贼，怎敢捏造流贼蛊惑人心？”反而让人笞之。
二十二日卯时，张部下骑兵手执红旗，自北门驰入。先进城流寇执红旗摇动，街巷店肆中纷纷相应，全都是流寇早已潜伏城内者。这个贪官自然是让杀了，两个女儿则为张献忠部下掳掠携去。城中士绅陆孝廉、赵主事俱被杀，一时间满城起火，献忠部下挨户先索骡马，次索金银子女，掳掠妇女被绳索捆成一窜。流寇大肆污秽。又释放牢里罪犯数百人，有愿意一起干的，马上发给武器。
张部在城中尽情破坏杀戮一天后离去，这个小县城百姓身死者千余人。
正月二十四日，张部攻舒城。知县章可试可不是严知县那废物，远远侦查流寇要来，立刻发动城里百姓塞住三个城门，却大开开西门，西门内早挖好了大陷坑，等流寇先头部队入城陷于坑内，埋伏民壮纷纷杀出。流寇惊慌下奔溃死近千人。
张献忠大怒，将掳掠霍山、合肥县妇女数千赶到城下月兑掉衣衫，只要有人稍微流露出悲伤立即乱刀分尸。企图威吓守城者。但是因此城内人害怕落得一样下场，更加悍不畏死，张部攻城三日不下，觉得在这小县城耽搁不值当，撤军而去。
正月二十七日，张献忠自舒城抵庐江。
城中富户派人送去金银粮秣哀求不要破城。张部假装答应，半夜却突然袭击攻夺城门，城陷，尽取子女玉帛而去。
正月二十八日，张部至无为州，派出部将四下掳掠。杀率兵出城御地的守备张某以及手下部众。又杀池河千户部，无为州遂陷。
正月三十，张献忠部下混天王趋庐州，重重包围。然而，一路顺风的张部在庐州城下却吃了打败仗。
庐州城池坚固，知府吴大朴素有能员之称，见混天王部流寇围城，亲率军民固守，昼夜拒战。城内街市，全部用砖石包檐环砌，防备贼寇火箭火炮。在城墙墙壁间以木石作掩体，让胆大勇壮者持刀枪埋伏在内，随时侦查警戒。城墙上灰瓶、火炮、药枪、喷枪、滚木等，穷尽城中，无不大量准备。
等到流寇开始攻城时，城墙上发百子炮，这种散弹炮距离虽然不远，但威力却是不小。攻城者死伤近千人。
混天王大怒下增加了攻城兵力，形势十分危急。知府吴大朴登上城楼四周观望，只见四面城墙全是混天王部流寇，大家慌乱下。吴大朴急令守城兵壮用火炮轰击，滚木灰瓶沸油纷纷落下。有勇壮流寇登城者，四围皆壁，人急切间难以转身，掩体内伏兵刀枪透缝隙刺出，登上城流寇因为掩体遮挡，一时难以招架，纷纷毙命。
混天王围城攻击七昼夜，城中随机应变，始终无法破城，无奈下转往别处。
张献忠麾下各部先后攻陷庐江(今庐江)，屠戮巢县(今巢县)、无为(今无为)及安庆府的潜山(今潜山)、太湖(今太湖)、宿松(今宿松)，后遇应天巡抚张国维的抵抗，又杀入湖北麻城，进入河南境内。
张献忠这部，南下庐州、安庆两府后，除庐江舒城没有攻打下来外，其余各城无不攻陷，令朝廷无法抵挡。所到处，百姓痛苦不堪。