這蕭摩訶也是太悲哀了，他奉命率軍在白土岡為陳後主賣命打仗，陳後主卻在宮中設宴，與他年輕貌美的繼妻**，並引上龍床，一連數日留置不歸。等他得知真情，已無心再戰，大罵幾聲昏君，準備率軍回宮中殺了陳叔寶解救愛妻，不料被隋兵活捉。
陳亡後，隋文帝楊堅授蕭摩訶開府儀同三司。不久，隨漢王楊諒至並州（山西太原）。隋仁壽四年（604年），蕭摩訶隨漢王楊諒起兵反對其兄楊廣稱帝。八月，蕭摩訶在于清源（今山西清徐）敗于隋名將楊素，被俘後被殺，時年73歲。此是後話。
當時，任忠馳馬進入建康台城（皇宮），謁見陳後主，敘說了失敗經過，然後說︰「陛下好自為之，我是無能為力了！」陳後主交給他兩串金子，讓他再募兵出戰，任忠說︰「陛下只有趕緊準備船只，前往上游會合周羅等人統領的大軍，我當豁出性命護送陛下。」陳後主相信了任忠，敕令他出外布置安排，又下令後宮宮女收拾行裝，等待任忠，久等不至，覺得奇怪。當時韓擒虎率軍從新林（南京城西南）向台城進發，任忠已經率領部下數騎到石子岡（南京城南雨花台附近）去投降。陳朝領軍將軍蔡徵率軍守衛朱雀航（秦淮河上浮橋），听說韓擒虎將到，部隊驚懼，望風潰逃。任忠帶領韓擒虎的軍隊徑直進入朱雀門，還有一些陳軍將士想進行抵抗，任忠對他們揮揮手說︰「我都投降了隋軍，你們還抵抗什麼！」于是陳軍全都逃散。此時，台城（皇宮）內文武大臣全都逃跑，只有尚書僕射袁憲在殿內，尚書令江總等數人在尚書省府中。陳後主對袁憲感嘆說︰「我從來對待你不比別人好，今日只有你還留在我的身邊，對此我感到很慚愧。這不只是朕失德無道所致，也是由于江東士大夫的氣節全都喪失淨盡了。」
禎明三年、開皇九年（589年）二月十日，隋軍攻入建康台城。陳後主驚慌失措，想要躲藏，袁憲嚴肅地說道︰「隋軍進入皇宮後，必不會對陛下有所侵侮。事已至此，陛下還能躲到什麼地方去？我請求陛下將衣服冠冕穿戴整齊，端坐正殿，依照當年梁武帝見侯景的做法。」陳後主不听，下榻急走自語道︰「鋒刃之下，未可兒戲，朕自有計。」于是跟著10余個宮人逃出後堂景陽殿，就要往井里跳，袁憲苦苦哀求，陳後主不听。後舍人夏侯公韻用自己的身子遮擋住井口，陳後主極力相爭，爭了很長時間才得以跳進井里。不久，有隋軍兵士向井里窺視，並大聲喊叫，井下無人回答，士兵揚言要落井下石，方才听到井下有人呼喚，于是拋下繩索往上拉人，感到非常沉重，十分吃驚，怎麼這麼重？都以為陳後主是一個大胖子，直到把人拉了上來，才發現陳後主與張麗華、孔貴嬪3人同索而上，隋兵皆大笑。後人有詩曰︰「擒虎戈矛滿六宮，春花無樹不秋風；倉皇益見多情處，同穴甘心赴井中。」
當時粉面黛目的張貴妃嚇得涕淚俱下，胭脂沾滿了石井欄，以帛拭之不去，遂留下胭脂痕跡。故民間稱「胭脂井」。
宋朝詩人陳孚有《胭脂井》詩雲︰「淚痕滴透綠苔香，回首宮中已夕陽。萬里河山天不管，只留一井屬君王。」宋朝曾鞏為此告誡後人，寫了辱井銘︰「辱井在斯，不可戒乎」刻于井欄上，故胭脂井，又名辱井。宋朝政治家王安石也曾在此留詩一首︰「結綺臨春草一丘，尚殘宮井成千秋。奢婬自是前王恥，不到龍沉亦可羞。」
隋兵入宮時，沈皇後仍像平常一樣，毫不驚慌。皇太子陳深當時年方15歲，關上門，安然端坐，太子舍人孔伯魚在一旁侍奉，隋軍兵士推門而入，陳深端坐不動，好言慰勞說︰「你們一路上鞍馬勞頓，還不至于過于疲勞吧？」隋軍兵士都紛紛向他致敬。當時陳朝宗室王侯在建康城中有100余人，陳後主恐怕他們發動政變，就把他們全都召進宮里，命令他們都聚集在朝堂，派遣豫章王陳叔英監督他們，並暗中嚴加戒備。到台城失守以後，他們都相繼出降。
高穎先進入建康，當時高穎的兒子高德弘是晉王府記室參軍，楊廣就派他馳馬來見高，傳令留下張麗華，高穎說︰「古時候姜太公呂尚蒙面斬了殷紂王的寵姬妲己，今天豈能留下張麗華！」于是將張麗華斬于青溪。高德弘還報楊廣，楊廣臉色大變說︰「古人雲︰‘無德不報。’我一定有辦法回報高公！」因此楊廣忌恨高穎。
正月月二十二日，晉王楊廣進入建康，認為陳朝中書舍人施文慶接受委命，卻不忠心國事，反而諂媚為奸，以蒙蔽天子耳目。前中書舍人沈客卿重賦厚斂，盤剝百姓，以博取天子的歡心，與太市令陽慧朗、刑法監徐析、尚書都令史暨慧景等人都是禍國害民的奸臣，一並斬于石闕下，以謝三吳地區百姓。楊廣又讓高熲和元帥府記室參軍裴矩一道收繳南陳地圖和戶籍，封存國家府庫，金銀財物一無所取。因此，天下都稱頌楊廣，認為他賢明。
隋朝開府儀同三司王頒是王僧辯的兒子，在一天夜里，他挖了陳高祖陳霸先的陵墓，焚毀了陳霸先的尸骨，並將骨灰投進水中然後喝下去，以報殺父之仇。隨後把自己捆綁起來，向晉王楊廣投案，請求治罪；楊廣把此事報告了隋文帝，隋文帝下令赦免了他。隋文帝又下詔令給陳高祖、陳世祖、陳高宗安排5戶守陵人，分別負責守護陵墓。
平定陳朝後，隋朝論功行賞，王頒因功應封柱國，受賜物5千段，之後又被封拜為代州（今山西太原府東北）刺史，又改任齊州（今山東濟南）刺史，死于任上，終年52歲。
開皇九年（589年）二月，隋朝納言蘇威上奏請求在地方上每500家設置鄉正一人，管理本鄉百姓，審理訴訟糾紛。內史令李德林認為︰「本來已經廢掉鄉一級官吏審理案件的權力，是因為他們和案件當事人鄉里鄉親，往往判案不公平，現在卻令鄉正專治一鄉500家，恐怕危害更大。況且有些邊遠荒僻小縣，百姓不滿500家，難道能讓兩縣共管一鄉？」隋文帝不听。初二，下制書說︰「民間500家為鄉，設置鄉正一人；100家為里，設置里長一人。」
孝宣帝陳頊在位時，由于窮兵黷武，與北周連年征戰，屢戰屢敗，陳國國土日削，國力日衰。到陳後主即位，陳國的國力已經相當不濟，處于崩潰的邊緣。
陳後主很有文才，但卻是一個完全不懂國事、只知道喝酒享樂的荒婬皇帝，致使朝政極度**。他「奏伎縱酒，作詩不輟」（《南史-陳本紀》）。陳後主為其妃張麗華作艷詞《玉樹後庭花》︰「麗宇芳林對高閣，新裝艷質本傾城；映戶凝嬌乍不進，出帷含態笑相迎。妖姬臉似花含露，玉樹流光照後庭；花開花落不長久，落紅滿地歸寂中！」後人以「玉樹後庭花，花開不復久」成為有名的亡國之音的代稱。唐朝詩人杜牧有詩《秦淮夜泊》︰「煙籠寒水月籠沙，夜泊秦淮近酒家；商女不知亡國恨，隔江猶唱後庭花。」
陳後主對酒文化的研究，也堪稱一絕，有獨酌謠二首為證。其一︰「獨酌謠，獨酌且獨謠。一酌豈陶署？二酌斷風飆，三酌意不暢，四酌情無聊，本酌盂易覆，六酌歡欲調，七酌累心去，八酌高志超，九酌忘物我，十酌忽凌霄。凌霄異羽翼，任致得飄飄。寧學世人醉，揚波去我遙。爾非浮丘伯，安見王子喬？」其二︰「獨酌謠，獨酌酒難消。獨酌三兩碗，弄曲兩三調。調弦忽未畢，忽值出房朝。更似游春苑，還如逢麗譙。衣香逐嬌去，眼語送杯嬌。余樽盡復益，自得是逍遙。」
陳後主的發妻沈皇後，既賢惠，有隱忍。後主一年半載才去看望一次，而且總是「暫入即返」，從不多作停留，沈後總是起身黯然相送，也無相留之言。于是後主作《戲贈沈後》一詩︰「留人不留人，不留人亦去。此處不留人，自有留人處。」後來發展為「此處不留爺，自有留爺處。」
陳後主一味貪圖酒色，最後丟掉了江山。據有關記載，南朝前期，有90多萬戶，人口近470萬。到了陳叔寶亡國的時候，南朝僅剩50萬戶，人口200萬，可謂是人口蕭條，社會凋敝。
導游說，六朝宮殿是當時中國最壯麗豪華的宮殿，由于侯景之亂，將一座絕代繁華的建康城糟踏得百孔千瘡，殘破不堪。台城的太極殿兼西堂省寺，也被王僧辯縱軍士燒毀，其他宮殿建築、典籍寶器、苑囿樓台以及華林園，幾乎被毀蕩殆盡。侯景之亂平定後，梁元帝蕭繹不願再在建康建都，于是定都湖北江陵，不久為西魏所滅。