京師保衛戰之後，作為兵部尚的石亨不但沒有為朝廷出力，還暗中指使佷子石彪拖葉三的後腿，使明軍初戰失利，更使朱祁鎮不滿。對于朱祁鎮的不滿，石亨並不是沒有感覺的，相應的，他也準備了自己的應對。埋伏在朱祁鎮周圍的大臣自不必說，他還刻意安排了自己的佷子石彪鎮守大同，自己則統帥京師駐軍，只要朱祁鎮一有動靜，便可里應外合。這是相當厲害的安排，進可攻，退可守，作為武將，石亨確實很有水平。
可石亨沒想到，這次京師勤王後，朱祁鎮就沒讓石彪再回大同。天順三年八月，一直默不作聲的朱祁鎮突然發飆，將石彪直接下了詔獄。朱祁鎮這一舉動大大出乎朝臣的預料，也把石亨搞懵了，讓他目瞪口呆。石彪被下獄，意味著自己的所有外援已經被清除干淨，單憑京師這點人馬，別說造反，連自保都不夠。石亨這才意識到眼前這位忠厚老實的皇帝已經不是以前的朱祁鎮了，經過這麼多年的歷練，那個處處依賴別人的年輕皇帝已經成為久經考驗，處理朝政經驗豐富的老手。現在石亨後悔讓石彪進京勤王，本打算讓石彪進京撈好處撈資歷，沒想到竹籃打水一場空，還把石彪搭進去了。現在後悔也晚了，石亨強打精神，振作起來，準備迎接朱祁鎮對自己的全面反擊。
可奇怪的是，朱祁鎮發了一次 以後又沒動靜了，沒動石亨一根毫毛。石亨實在搞不清楚朱祁鎮想干什麼，只有以退為進，上痛陳自己對佷子的罪責負有責任，請求聖上恩準他罷官辭職回家種田。
而朱祁鎮總是和顏悅色地說石彪的事情和他一點關系都沒有，讓他放心地做他的兵部尚。這次石亨又相信了朱祁鎮的話，便不再堅持辭官，同時也放棄了對朱祁鎮的防備之心，也放棄了最後一線生機。
自從在慈寧宮和錢皇後的一番夜話，朱祁鎮就決心整頓吏治，采取的手段也不同于常人，他放棄了從中央突破，避免朝局動蕩，而是采用旁敲側擊的手段，令朱祁鎮要清理的對象防不勝防。當朱祁鎮決定放棄曹吉祥而重用葉三的那天起，他就決定先除去曹吉祥的羽翼石亨，他做了充足的準備，一點一點清除石亨的勢力，不顯山不露水策反了石亨身邊的人，然後掌握了石亨的一舉一動。
于是石亨的罪證通過被他策反的人源源不斷地送到了宮內，而石亨還蒙在鼓里，過著平安無事，萬事大吉的生活。等朱祁鎮清理完石亨的其他部下，逐步完成清除外圍的工作後，石亨已經成了孤家寡人，不堪一擊了。出乎意料的是，在這關鍵時刻，朱祁鎮卻放棄了進攻，遲遲不向石亨下手。所有知情的人對此十分不解，都不明白既然已經到了這種地步，為什麼皇上不干脆解決掉石亨呢？
在朝臣中，還是葉三最了解朱祁鎮，他明白朱祁鎮為何放棄對石亨的最後一擊，朱祁鎮這些奇怪的舉動都在他的預料之中。這位經他教過的皇帝，雖然歷經風波，但是歸根到底還是個比較忠厚、念及舊情的皇帝，他連擁立自己弟弟篡位的于謙都不忍殺害，更何況是曾經有過奪門之功的石亨？葉三很清楚，要想讓朱祁鎮徹底放棄那最後的慈悲，只有一個方法，就是揭開奪門之變的真相。
葉三心里始終存想找機會把奪門之變的真相面陳朱祁鎮，說機會機會就來了。當葉三下朝走出御門時，竟然听見一個年輕文官大聲說道︰「支持戶部尚葉三重組內閣，把宦官集團趕出朝廷！」葉三默默不語，看來曹吉祥真的不如從前了，要是在以前，誰敢當眾詬病宦官集團啊？他正要離開御門這是非之地時，就听見一個尖利的聲音︰「葉大人請留步。」
葉三回頭見是太監馬朝，便打拱招呼道︰「馬公公。」
馬朝昂起頭，拿腔作勢︰「口諭！說給葉三听。」葉三听罷自然十分利索地跪倒听旨，就像條件反射那樣干脆。
「宣葉三即刻進宮見朕，朕有話要和他說。」
葉三高呼︰「臣領旨謝恩，吾皇萬歲萬萬歲。」
馬朝帶著葉三去了西苑，那是宮中極盡華貴的園林，至今嘆為觀止。葉三和馬朝進了一座琉璃瓦的華麗樓閣，許多宮女太監侍立在過道一旁，朱祁鎮應該就在里面。
「微臣葉三叩見皇上萬歲萬萬歲。」葉三立刻跪下行朝禮。朱祁鎮把目光轉過來，和顏悅色地道︰「平身，葉三你到這邊來坐。」
「臣謝恩。」葉三從地上爬起來，躬身走到朱祁鎮的下首，那里有個凳子。朱祁鎮放下茶杯，一副漫不經心的神態︰「朕下旨讓你補戶部尚，並提起你入閣之事，位大九卿之列，是想讓你有所作為，你現在給朕說說，有什麼治國方略。嗯，牛玉是內廷的人，讓他听听，以便相互協作，盡快實施政略。」
葉三心道當我是傻子呢？我既然增補閣臣，還要和內廷攜手？別忽悠我了︰「皇上恩寵，臣誠惶誠恐，就怕資歷學識不足以擔當重任，辜負了皇上的期望。」
朱祁鎮不以為然地道︰「有朕支持你，你只管把事兒辦好就成。你且說說，準備怎麼辦？」作為一個大臣，誰沒有點澄清宇內留名青史的抱負呢？葉三听到這里心里十分激動，但是他不敢得意忘形，他沉住氣，沉思許久才說道︰「當今國家大事，攘外必先安內，以清除內患為首要。其次無非軍政錢三樣。要想有所改善，清除內患，穩定地方，增強國力，臣以為要先辦首要之事。」
朱祁鎮十分期待，在他的印象里，葉三無論說得對錯，總是會提出一些實用的建議，而不是像其他臣子那樣開口閉口就是一大堆道理，實際上一點有用的東西都沒有。
「你說，首要的事是什麼事？」
葉三頓了頓，看了一眼一旁的牛玉︰「揭露朝堂欺瞞皇上的事，不瞞皇上，當初也曾有人勸微臣參與奪門，可被微臣拒絕了。」
「什麼？」朱祁鎮大感意外，怎麼葉三突然說起奪門之事，他馬上厲聲追問︰「當初不是你救了朕嗎？那你為何又退出不參加了呢？」
葉三不慌不忙地道︰「因為即使不奪門，只要皇上性命無憂，皇位依然是皇上的，既然如此，微臣又何必去奪呢？」
朱祁鎮被葉三說糊涂了，這是什麼意思？如果沒有曹吉祥和石亨等人奪門，朕又怎麼會坐上皇位？他滿臉狐疑地看著葉三，等待葉三給他一個答案，解除他的狐疑。
牛玉在一旁听到葉三說到此處，已經明白了個大概，心道葉三啊葉三，你實在是高，我牛玉有何德何能成為你的對手？咱家只配給你牽馬綴鐙了。
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