就在陳雨修整林竹、龍駒、武關城池，安置流民這段時間，朝野之間發生了許多事情。
首先是正月里，兵部職方主事賀王聖，劾溫體仁（內閣首輔）庸奸誤國。讓崇禎發配任地方官去了。
御史吳履中，彈劾溫體仁、王應熊並及監視內臣。崇禎下旨責問。
崇禎大概也覺得皇親國戚太多不干事情白吃飯的。一直想做個有為明君，挽救大明，所以在正月里為此事情下旨︰凡郡王子孫有文武才能堪任用者，宗人府具以名聞，朝廷考驗，授以職，遷除如常例。
侍郎陳子壯上言︰「宗秩改授，適開僥幸之門，亂藩規，混銓政。」這無疑打擊了要改革朝政弊端的崇禎，以沮詔間親，下陳子壯牢獄。
到了第二年四月，才釋放了他。可惜這些宗室當官後，並沒有如崇禎所想，同一血脈而為大明出力。一個個貪贓枉法，公私苦之。
洪承疇與正月率軍赴河南時，各部賊寇往來不定，在豫中月復地，關陝以東，黃河以南，襄陽以北，延袤數千里，所在馳突。使得他四處追堵，窮于應付。
而此刻，破了鳳陽的農民軍分三路開始四處掃蕩。
高迎祥、李自成等率領一軍，于鳳陽府太和縣進入河南。經河南鹿邑、杞縣，進入密縣山中。
掃地王張一川等率軍，攻毫州(今安徽亳縣)，走河南夏邑，圍歸德。
以張獻忠為首的部隊，則殺入廬州府境內。
正月二十一日，張部至柘皋劫掠。流寇洶涌而來快進入縣境時候，有難民奔走告知知縣嚴某。這個平時只知道搜刮民脂民膏的無能之輩卻不信，對報信人說︰「不過是小股盜賊，怎敢捏造流賊蠱惑人心？」反而讓人笞之。
二十二日卯時，張部下騎兵手執紅旗，自北門馳入。先進城流寇執紅旗搖動，街巷店肆中紛紛相應，全都是流寇早已潛伏城內者。這個貪官自然是讓殺了，兩個女兒則為張獻忠部下擄掠攜去。城中士紳陸孝廉、趙主事俱被殺，一時間滿城起火，獻忠部下挨戶先索騾馬，次索金銀子女，擄掠婦女被繩索捆成一竄。流寇大肆污穢。又釋放牢里罪犯數百人，有願意一起干的，馬上發給武器。
張部在城中盡情破壞殺戮一天後離去，這個小縣城百姓身死者千余人。
正月二十四日，張部攻舒城。知縣章可試可不是嚴知縣那廢物，遠遠偵查流寇要來，立刻發動城里百姓塞住三個城門，卻大開開西門，西門內早挖好了大陷坑，等流寇先頭部隊入城陷于坑內，埋伏民壯紛紛殺出。流寇驚慌下奔潰死近千人。
張獻忠大怒，將擄掠霍山、合肥縣婦女數千趕到城下月兌掉衣衫，只要有人稍微流露出悲傷立即亂刀分尸。企圖威嚇守城者。但是因此城內人害怕落得一樣下場，更加悍不畏死，張部攻城三日不下，覺得在這小縣城耽擱不值當，撤軍而去。
正月二十七日，張獻忠自舒城抵廬江。
城中富戶派人送去金銀糧秣哀求不要破城。張部假裝答應，半夜卻突然襲擊攻奪城門，城陷，盡取子女玉帛而去。
正月二十八日，張部至無為州，派出部將四下擄掠。殺率兵出城御地的守備張某以及手下部眾。又殺池河千戶部，無為州遂陷。
正月三十，張獻忠部下混天王趨廬州，重重包圍。然而，一路順風的張部在廬州城下卻吃了打敗仗。
廬州城池堅固，知府吳大樸素有能員之稱，見混天王部流寇圍城，親率軍民固守，晝夜拒戰。城內街市，全部用磚石包檐環砌，防備賊寇火箭火炮。在城牆牆壁間以木石作掩體，讓膽大勇壯者持刀槍埋伏在內，隨時偵查警戒。城牆上灰瓶、火炮、藥槍、噴槍、滾木等，窮盡城中，無不大量準備。
等到流寇開始攻城時，城牆上發百子炮，這種散彈炮距離雖然不遠，但威力卻是不小。攻城者死傷近千人。
混天王大怒下增加了攻城兵力，形勢十分危急。知府吳大樸登上城樓四周觀望，只見四面城牆全是混天王部流寇，大家慌亂下。吳大樸急令守城兵壯用火炮轟擊，滾木灰瓶沸油紛紛落下。有勇壯流寇登城者，四圍皆壁，人急切間難以轉身，掩體內伏兵刀槍透縫隙刺出，登上城流寇因為掩體遮擋，一時難以招架，紛紛斃命。
混天王圍城攻擊七晝夜，城中隨機應變，始終無法破城，無奈下轉往別處。
張獻忠麾下各部先後攻陷廬江(今廬江)，屠戮巢縣(今巢縣)、無為(今無為)及安慶府的潛山(今潛山)、太湖(今太湖)、宿松(今宿松)，後遇應天巡撫張國維的抵抗，又殺入湖北麻城，進入河南境內。
張獻忠這部，南下廬州、安慶兩府後，除廬江舒城沒有攻打下來外，其余各城無不攻陷，令朝廷無法抵擋。所到處，百姓痛苦不堪。