魏文帝黃初六年（癸卯，公元225年）蜀漢諸葛亮率兵討伐雍，參軍馬謖送行數十里。諸葛亮說︰「雖然我們一起謀劃此事多年，今天請你再一次提出好計劃。」馬謖說︰「南中依恃地形險要和路途遙遠，叛亂不服已經很久了。即使我們今天將其擊潰，明天他們還要反叛。目前您正準備集中全國的力量北伐，以對付強賊，叛匪知道國家內部空虛，就會加速反叛。如果將他們全部殺光以除後患，既不是仁厚者所為，也不可能在短期內辦到。用兵作戰的原則，以攻心為上，攻城為下；以心理戰為上，以短兵相接為下，望您能使其真心歸服。」諸葛亮采納了馬謖的建議。馬謖是馬良的弟弟。
蜀漢諸葛亮到達南中，征討叛亂，所到必勝。諸葛亮從越進兵，斬殺雍柯和高定。派降督、益州人李恢從益州進兵，門下督、巴西人馬忠從進兵，擊潰南中各縣的叛軍，再度和諸葛亮會合，孟獲收拾雍的殘部抗拒諸葛亮。孟獲深得當地漢人和夷族的信賴，諸葛亮要生擒孟獲，以後果然將孟獲俘獲，讓他參觀了蜀軍的軍營戰陣，問他說︰「這樣的軍隊如何？」孟獲說︰「以前不知道你們的虛實，所以遭到失敗。如今蒙您允許我參觀你們的軍營戰陣，如果貴軍只是這樣的軍隊，我一定能輕易取勝。」諸葛亮笑了笑，將孟獲釋放，要他再戰。前後把孟獲放回七次，又生擒七次，最後諸葛亮仍將孟獲釋放，孟獲卻不再走了，對諸葛亮說︰「您有天威，南方人不會再反叛了！」于是諸葛亮到達滇池。
益州、永昌、柯、越四郡都被平定了，諸葛亮仍然任用當地原來的首領為四郡的地方官吏。有人勸諸葛亮不要這樣做，諸葛亮說︰「如果留外地人為官，則要留駐軍隊，留駐軍隊，則糧秣供應困難，這是第一個難題；這些夷族剛受過戰爭之苦，父兄多有死傷，怨氣未消，任用外地人而不留駐軍隊，定有禍患，這是第二個難題；這些夷族叛亂分子屢次三番殺死和廢掉官吏，自知有罪，與我們隔閡很深，若留下外地人為官，終究難以被他們信任，這是第三個難題。我現在是要不留軍隊，不轉運糧食，使法令、政紀大體得以貫徹，讓夷族和漢人大何安定下來。」于是諸葛亮網羅孟獲等當地的著名人物，任命為地方官使，讓他們貢獻金、銀、丹、漆、耕牛、戰馬，供給軍隊和朝廷使用。從此之後，在諸葛亮的有生之年，這一地區的夷族再也沒有反叛。
魏文帝黃初七年（癸卯，公元226年）蜀漢丞相諸葛亮準備出兵至漢中，前將軍李嚴負責後方事務，移駐江州，留護軍陳到駐軍永安，歸屬李嚴指揮。
魏明帝太和元年（丁未，公元227年）三月，蜀漢丞相諸葛亮率領各路軍隊向北挺進，駐軍漢中，以長史張裔、參軍蔣琬留下處理丞相府的各項政務。出發前，諸葛亮上書說︰「先皇帝開創大業，剛剛見些成效，卻中途溘然長逝了。如今的天下分成三個政權鼎足而立，要算益州的蜀國最為貧窮困乏，這正是一個生死存亡的時刻。然而身邊近臣仍能兢兢業業、毫不怠懈地在朝內盡其職守；忠勇將士舍身奮戰在沙場，出生入死，是因為追念先皇帝的知遇之恩，想要全力報答給陛下。陛下正應虛心听取各方面意見，發揚光大先皇帝遺下的威德，振奮有志之士的氣節；而不應自己輕視自己，講出不合道理的話來，以致阻塞忠臣進諫的渠道。
「宮廷和相府，是一個整體，提升、貶黜、表彰、指責，不應有什麼區別。如果有觸犯法紀的行為，或盡忠立功的表現，應該讓有關部門按規定給予處罰、獎賞，以顯示陛下公允、明察，不能有偏私之心，使宮廷內外執法不統一。
「侍中郭攸之、費、侍郎董允等人，都是善良誠實、思想純正的忠臣，所以先皇帝特意選拔他們留下來輔佐陛下。我以為宮廷中事務，不論大小，都應先和他們商議，然後再付諸實施，這樣一定能彌補缺漏，得到更多的好處。將軍向寵，品行平和公正，通曉軍事，在以前經過考驗，先皇帝答贊他很有才能，所以被大家推舉為掌管禁兵的中部督。我認為各項軍務，都應征求他的意見，必定會令將士和睦，使才智出眾和能力較差的人都能各得其所。
「親近賢臣，疏遠小人，這是前漢得以興盛的原因；親近小人，疏遠賢臣，這是後漢衰敗的根由。先皇帝在世，每次與我談起這些，沒有一次不對桓帝、靈帝時代的政治腐敗痛心疾首。侍中郭攸之、費，尚書陳震，長史張裔，參軍蔣琬，都是端正善良、能以死報國的忠臣，希望陛下親近他們，信任他們，則漢室的興盛，將指日可待。
「我本是一介平民，在南陽親自耕作，本來只想在風雨飄搖的動蕩年代保全性命，從未想通達貴顯，名揚天下。先皇帝不嫌棄我地位卑下，屈尊俯就，三次往茅廬相訪，向我詢問天下形勢，使我感激萬分，這才答應為先皇帝奔走效命。後來軍事上遇到挫折，在敗軍之際承擔重任，在危難時刻接受使命，從那時至今，已整整二十一年了。先皇帝深知我行事謹慎，因此在臨終前托付國家大事。
「自從接受先皇帝遺命以來，日夜憂慮嘆息，唯恐辜負重托，有損先皇帝知人之明。于是五月渡過瀘水，深入到荒涼的不毛之地。如今南方已經平定，軍力棄足，正應當激勵將士，統率三軍北定中原，我願竭盡平庸之力，鏟除奸賊，恢復大漢皇室，重返故都，這正是我報答先皇帝，效忠陛下的本分。至于處理政事，掌握分寸，進納忠言，則是郭攸之、費、董允等人的職責。希望陛下將討伐國賊、復興大漢朝廷的重任交給我，若無成效，請您治罪，以告先皇帝在天之靈；如果郭攸之、費、董允疏忽失職，就責備追究他們的過錯。陛下自己也應慎重考慮，征詢和選擇妥善的治國方略，訪察、采納好的建議，真正遵循先皇帝遺訓。如此則臣下我就受恩不淺，感激不盡了。現在將要遠離陛下，在寫這份表章時激動得淚流不止，不知該說些什麼。」于是率軍出發，駐屯在沔水北岸的陽平石馬。
諸葛亮征召廣漢太守姚為丞相掾，姚同時推薦了很多文武官員，諸葛亮稱贊他說︰「對國家效忠進益，莫過于舉薦人才，但推薦者往往根據自己的崇尚。而今掾屬姚舉薦官員，卻能剛柔並濟地同時推舉文官武將，以備國家之用，可稱廣博典雅。希望各位掾屬都以姚為榜樣，不負我對你們的期望。」